Τα βασικά γάγγλια, ή βασικοί πυρήνες, είναι δομές στον εγκέφαλο που βοηθούν στον έλεγχο της κίνησης. Ο ομαλός κινητικός έλεγχος, όπου η κίνηση ξεκινά, εξελίσσεται και τελειώνει όπως αναμένεται, συντονίζεται εν μέρει από τα βασικά γάγγλια. Η λειτουργία των βασικών γαγγλίων μπορεί να διαταραχθεί από ορισμένες ασθένειες, οδηγώντας σε δυσκολίες στην ομιλία καθώς και στην κίνηση. Στη νόσο του Πάρκινσον, τα κύτταρα στα βασικά γάγγλια πεθαίνουν, οδηγώντας σε συμπτώματα βραδείας κίνησης, ανακίνησης και κλειδώματος των μυών. Καταστάσεις όπως τραυματισμοί στο κεφάλι, όγκοι στον εγκέφαλο, εγκεφαλικά επεισόδια και φάρμακα μπορούν επίσης να βλάψουν τα εγκεφαλικά κύτταρα και να επηρεάσουν τη λειτουργία των βασικών γαγγλίων.
Ένας αριθμός διαφορετικών ανατομικών δομών στον εγκέφαλο περιλαμβάνονται στα βασικά γάγγλια. Τα ονόματα αυτών των τμημάτων είναι η ουσία ουσία, η σφαίρα του παλιδού, ο υποθαλαμικός πυρήνας, ο κουταμικός και ο ουρανός. Ενώ η λειτουργία των βασικών γαγγλίων δεν είναι πλήρως κατανοητή, πιστεύεται ότι εμπλέκονται στην εκκίνηση της κίνησης και στην εκτέλεση μαθημένων ακολουθιών κινήσεων. Είναι πιθανό ότι τα βασικά γάγγλια θα μπορούσαν να καταστέλλουν άλλα προγράμματα δράσης επιτρέποντας παράλληλα την εκτέλεση ενός επιθυμητού προγράμματος. Αυτό θα εμπόδιζε τον εγκέφαλο να προσπαθεί να πραγματοποιήσει πολλές αντικρουόμενες κινήσεις ταυτόχρονα.
Η λειτουργία των βασικών γαγγλίων περιλαμβάνει την αποστολή νευρικών σημάτων κατά μήκος δύο διαφορετικών οδών, ένα από τα οποία είναι άμεσο και το άλλο έμμεσο. Αυτά τα σήματα μεταδίδονται σε μέρος του πρόσθιου εγκεφάλου γνωστό ως θαλάμος, το οποίο τα μεταδίδει στον εγκεφαλικό φλοιό, τη φαιά ουσία του εγκεφάλου. Πιστεύεται ότι το έμμεσο μονοπάτι καταστέλλει κάθε αντικρουόμενη ενέργεια, ενώ το άμεσο μονοπάτι επιτρέπει την εκτέλεση μιας συγκεκριμένης εργασίας. Για κανονική κίνηση, τα μονοπάτια πρέπει να συνεργάζονται σωστά και οτιδήποτε διαταράσσει την ισορροπία μεταξύ τους μπορεί να προκαλέσει κινητική διαταραχή, όπως η νόσος του Πάρκινσον.
Στη νόσο του Πάρκινσον, τα κύτταρα στο εσωτερικό της ουράς πεθαίνουν και άλλες περιοχές των βασικών γαγγλίων επηρεάζονται καθώς η κατάσταση εξελίσσεται. Η απώλεια κυττάρων στην ουσία αναστατώνει την ισορροπία των νευρικών οδών, καθιστώντας την έμμεση διαδρομή πιο ενεργή και την άμεση διαδρομή λιγότερο ενεργή. Συνολικά, το αποτέλεσμα είναι να μειωθεί η κίνηση και αυτό οδηγεί σε ανακατεμένο βάδισμα που συνοδεύεται από προβλήματα ισορροπίας, άκαμπτους μύες και τρόμο όταν είστε σε ηρεμία. Αν και η νόσος δεν μπορεί να θεραπευτεί, υπάρχουν διαθέσιμες θεραπείες που μπορούν να επιβραδύνουν την εξέλιξη και να βοηθήσουν στην ανακούφιση των συμπτωμάτων. Μπορούν να ληφθούν φάρμακα που παρέχουν ουσίες όπως η ντοπαμίνη, ένας νευροδιαβιβαστής που παράγεται κανονικά από κύτταρα στην ουσία μαύρο και που μεταφέρει σήματα από το ένα νευρικό κύτταρο στο άλλο.