Το κύριο πλεονέκτημα της χρήσης ιντερφερόνης για την ηπατίτιδα Β είναι το σχετικά υψηλό ποσοστό ανταπόκρισης μεταξύ των ασθενών. Η ίδια η θεραπεία είναι γενικά απλή και αποτελείται από ένα τακτικό πρόγραμμα ενέσεων. Ωστόσο, η λήψη ιντερφερόνης για την ηπατίτιδα Β δεν είναι χωρίς τα μειονεκτήματά της, καθώς έχει βρεθεί ότι η θεραπεία έχει πολλές φυσικές παρενέργειες. Η θεραπεία με ιντερφερόνη είναι επίσης ακριβή. εκτός από τις ενέσεις, απαιτεί συνεχή παρακολούθηση του αίματος του ασθενούς για τυχόν θετικές ή αρνητικές απαντήσεις στη θεραπεία. Το ποσοστό επιτυχίας μικρότερο από 50 τοις εκατό και ο κίνδυνος επιβλαβών παρενεργειών μπορεί να μην είναι ελκυστικά για άτομα με περιορισμένους πόρους.
Σε πολλά άτομα, μια λοίμωξη από ηπατίτιδα Β θεωρείται οξεία και μπορεί να απομακρυνθεί από τα συστήματά τους χωρίς καθόλου θεραπεία. Οι ασθενείς που χρειάζονται ιντερφερόνη για θεραπεία ηπατίτιδας Β αντιπροσωπεύουν λιγότερο από το 1 τοις εκατό όλων των περιπτώσεων. Σε περίπτωση που η λοίμωξη είναι χρόνια, η θεραπεία καθίσταται απαραίτητη για την πρόληψη σοβαρών βλαβών στο ήπαρ, η οποία με τη σειρά της μπορεί να θέσει σε κίνδυνο τη ζωή του ασθενούς.
Η ιντερφερόνη είναι μια ουσία που απαντάται φυσικά στο ανθρώπινο σώμα και παίζει ζωτικό ρόλο στην άμυνα του συστήματος από ιογενείς επιθέσεις, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που προκαλούνται από τον ιό της ηπατίτιδας Β. Η θεραπεία της ηπατίτιδας Β συνήθως περιλαμβάνει ιντερφερόνη Άλφα-2Β, αλλά μπορεί επίσης να περιλαμβάνει και Άλφα-2Α. Η έγχυση ιντερφερόνης μπορεί να βοηθήσει στη βελτίωση της ικανότητας του ασθενούς να καταπολεμά φυσικά την ηπατίτιδα Β, καταπνίγοντας την ικανότητα του ιού να πολλαπλασιάζεται.
Η χρήση ιντερφερόνης για την ηπατίτιδα Β έχει βρεθεί ότι επηρεάζει ευνοϊκά όσους πάσχουν από τη νόσο. Περίπου το 45 τοις εκατό των ασθενών που υποβάλλονται σε εβδομαδιαίες θεραπείες για τέσσερις έως έξι μήνες αναφέρουν ανακούφιση των συμπτωμάτων: η ναυτία, οι πόνοι στο σώμα, ο έμετος και άλλα σημεία που σχετίζονται με τη νόσο μειώνονται σημαντικά. Περίπου το 35 τοις εκατό των ασθενών θα αναφέρουν μακροχρόνια ανταπόκριση στη θεραπεία, ενώ περίπου το 20 έως 25 τοις εκατό των ασθενών ανταποκρίνονται αρκετά θετικά στη θεραπεία ώστε ο ιός να εξαλειφθεί πλήρως από τα συστήματά τους. Το ποσοστό επιτυχίας της χρήσης ιντερφερόνης για την ηπατίτιδα Β ποικίλλει ανάλογα με τη γενετική δομή του ασθενούς και τον ίδιο τον ιό της ηπατίτιδας Β.
Τα αυξημένα επίπεδα ιντερφερόνης σε ορισμένα άτομα οδηγούν σε συμπτώματα που μοιάζουν με γρίπη, όπως κόπωση και πυρετό. Οι ασθενείς έχουν επίσης αναφέρει ότι βιώνουν πόνο στο σώμα, αϋπνία και ξηροστομία. Άλλες πιθανές παρενέργειες της χρήσης ιντερφερόνης για την ηπατίτιδα Β περιλαμβάνουν αυξημένη ευερεθιστότητα, μειωμένες νοητικές ικανότητες, ακόμη και την ανάπτυξη υπερθυρεοειδισμού. Ως εκ τούτου, εναλλακτικές θεραπείες ηπατίτιδας συνιστώνται σε άτομα που έχουν ιστορικό προβλημάτων υγείας στην καρδιά ή το νευρικό σύστημα.