Αν και η κύρια χρήση της νατριούχου παντοπραζόλης είναι στη θεραπεία των γαστρεντερικών ελκών, η έρευνα έχει βρει ότι έχει μια σειρά από άλλες αποτελεσματικές χρήσεις. Ένας άλλος τρόπος με τον οποίο μπορεί να χρησιμοποιηθεί το φάρμακο είναι στη θεραπεία της γαστροοισοφαγικής παλινδρόμησης, καθώς και της διαβρωτικής οισοφαγίτιδας, η οποία εμφανίζεται κυρίως όταν τα συμπτώματα της γαστροοισοφαγικής παλινδρόμησης δεν αντιμετωπίζονται. Επιπλέον, αυτό το φάρμακο έχει βρεθεί ότι παρέχει ανακούφιση σε όσους πάσχουν από χρόνιες ασθένειες που σχετίζονται με την υπερπαραγωγή οξέος στομάχου.
Μία από τις πιο κοινές χρήσεις της νατριούχου παντοπραζόλης είναι στη θεραπεία γαστρεντερικών ελκών. Η νατριούχος παντοπραζόλη έχει βρεθεί ότι είναι αποτελεσματική στη θεραπεία αυτής της πάθησης λόγω της ικανότητάς της να μειώνει το οξύ του στομάχου, επιτρέποντας έτσι στα έλκη περισσότερο χρόνο για επούλωση. Επιπλέον, αυτό το φάρμακο έχει βρεθεί ότι είναι αποτελεσματικό στην πρόληψη περαιτέρω έλκους στομάχου, καθιστώντας το μια εξαιρετική επιλογή για άτομα που δεν μπορούν να υποβληθούν σε επιθετικές μορφές θεραπείας για την πάθηση
Η νατριούχος παντοπραζόλη έχει επίσης βρεθεί ότι είναι ιδιαίτερα αποτελεσματική στη θεραπεία βακτηριακών λοιμώξεων. Η έρευνα έχει βρει, ωστόσο, ότι το φάρμακο είναι πιο αποτελεσματικό όταν χρησιμοποιείται στη θεραπεία λοιμώξεων που σχετίζονται με το βακτήριο Helicobacter pylori. Στις περισσότερες περιπτώσεις, αυτές οι λοιμώξεις εμφανίζονται στο γαστρεντερικό σωλήνα και είναι αρκετά σοβαρές όταν αφεθούν χωρίς θεραπεία. Συχνά, οι ασθενείς στους οποίους έχει συνταγογραφηθεί νατριούχος παντοπραζόλη για τη χρήση θεραπείας βακτηριακών λοιμώξεων πρέπει επίσης να λαμβάνουν προβιοτικά, προκειμένου να διασφαλιστεί η καλή λειτουργία του πεπτικού συστήματος.
Όσοι έχουν διαγνωστεί με γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση, αλλιώς γνωστή ως ΓΟΠΝ, μπορούν επίσης να επιτύχουν ανακούφιση μέσω της χρήσης νατριούχου παντοπραζόλης. Η ΓΟΠΝ είναι μια κατάσταση κατά την οποία τα οξέα από το στομάχι παλινδρομούν στον οισοφάγο, προκαλώντας καούρα και άλλα επώδυνα συμπτώματα. Όταν αφεθεί χωρίς θεραπεία, η ΓΟΠΝ μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη διαβρωτικής οισοφαγίτιδας, η οποία είναι μια κατάσταση κατά την οποία η επένδυση του οισοφάγου έχει καταστραφεί από την επανειλημμένη έκθεση στο οξύ του στομάχου.
Η νατριούχος παντοπραζόλη έχει επίσης βρεθεί ότι είναι μια αποτελεσματική μορφή θεραπείας για όσους υποφέρουν από ασθένειες που οδηγούν στην υπερπαραγωγή οξέος στομάχου. Στις περισσότερες περιπτώσεις, όσοι χρησιμοποιούν νατριούχο παντοπραζόλη για αυτόν τον σκοπό μπορεί να παραμείνουν στο φάρμακο για μεγάλο χρονικό διάστημα, αν όχι για όλη τους τη ζωή. Τυπικά, σε αυτούς τους ασθενείς χορηγείται μια πολύ μικρή δόση του φαρμάκου, προκειμένου να αποφευχθεί η συσσώρευση τοξικών.