Οι παρενέργειες της βαρφαρίνης περιλαμβάνουν αιμορραγία, νέκρωση, μείωση της οστικής πυκνότητας και σύνδρομο μωβ δακτύλου. Αυτές οι παρενέργειες προκαλούνται συχνά από την αλληλεπίδραση της βαρφαρίνης είτε με κοινά φάρμακα είτε με ορισμένα τρόφιμα. Οι παρενέργειες της βαρφαρίνης πρέπει να παρακολουθούνται προσεκτικά για να διασφαλιστεί ότι η δοσολογία της είναι επαρκής και ασφαλής. Ημερήσιες εξετάσεις του αίματος του ασθενούς μπορεί να είναι απαραίτητες κατά τα αρχικά στάδια της θεραπείας με βαρφαρίνη. Ο πρωταρχικός στόχος αυτής της εξέτασης είναι να διασφαλιστεί ότι η βαρφαρίνη δεν προκαλεί στον ασθενή αιμορραγία.
Η αιμορραγία είναι μια από τις πιο συχνές παρενέργειες της βαρφαρίνης και εμφανίζεται σε έως και 2.7 τοις εκατό των περιπτώσεων. Ένας γιατρός πρέπει πάντα να σταθμίζει τα οφέλη έναντι των κινδύνων αιμορραγίας πριν συνταγογραφήσει βαρφαρίνη. Συγκεκριμένα παραδείγματα αιμορραγίας λόγω βαρφαρίνης περιλαμβάνουν μώλωπες, βήχα με αίμα, ρινορραγίες και αιματηρά ούρα. Ο κίνδυνος αιμορραγίας αυξάνεται περαιτέρω όταν η βαρφαρίνη συνδυάζεται με μη στεροειδή αντιφλεγμονώδη φάρμακα και αντιαιμοπεταλιακά φάρμακα. Οι ασθενείς που υποβάλλονται σε αιμοκάθαρση και οι ηλικιωμένοι διατρέχουν αυξημένο κίνδυνο αιμορραγίας όταν λαμβάνουν βαρφαρίνη.
Η νέκρωση είναι μία από τις σπάνιες παρενέργειες της βαρφαρίνης που επηρεάζει κυρίως το δέρμα και τα άκρα. Είναι πιο πιθανό να εμφανιστεί σε ασθενείς που έχουν ανεπάρκεια σε πρωτεΐνη C, ένα άλλο αντιπηκτικό που απαιτεί βιταμίνη Κ. Η βαρφαρίνη αρχικά μειώνει το επίπεδο της πρωτεΐνης C στο αίμα πιο γρήγορα παρά μειώνει τους παράγοντες πήξης. Αυτό μπορεί να οδηγήσει σε μαζικούς θρόμβους αίματος, που μπορεί να προκαλέσουν νέκρωση και γάγγραινα. Οι ασθενείς που διατρέχουν κίνδυνο από νέκρωση βαρφαρίνης συνήθως λαμβάνουν ηπαρίνη σε συνδυασμό με βαρφαρίνη.
Η μείωση της οστικής πυκνότητας, γνωστή και ως οστεοπόρωση, μπορεί επίσης να είναι μία από τις παρενέργειες της βαρφαρίνης. Μια μελέτη το 1999 στην οποία συμμετείχαν 572 γυναίκες που έπαιρναν βαρφαρίνη έδειξε αύξηση στα κατάγματα των πλευρών και της σπονδυλικής στήλης. Μια άλλη μελέτη σε άνδρες το 2006 συσχέτισε τη χρήση βαρφαρίνης για τουλάχιστον ένα χρόνο με 60% αύξηση στον κίνδυνο καταγμάτων των οστών λόγω οστεοπόρωσης. Ο αυξημένος κίνδυνος οστεοπόρωσης από τη βαρφαρίνη μπορεί να οφείλεται στην απαίτηση για βιταμίνη Κ στο σχηματισμό ορισμένων πρωτεϊνών των οστών.
Το σύνδρομο πορφυρού δακτύλου είναι μια από τις σπάνιες παρενέργειες της βαρφαρίνης. Το κύριο σύμπτωμα είναι ένας μπλε ή μοβ αποχρωματισμός που επηρεάζει περισσότερο το μεγάλο δάχτυλο του ποδιού, αλλά μπορεί επίσης να εμφανιστεί και σε άλλα μέρη των ποδιών. Το σύνδρομο μωβ δακτύλου εμφανίζεται συνήθως εντός οκτώ εβδομάδων μετά την έναρξη της θεραπείας με βαρφαρίνη. Η πιθανή αιτία του συνδρόμου μωβ δακτύλων είναι η εναπόθεση χοληστερόλης στο δέρμα των ποδιών.