Οι παρενέργειες της σουκραλφάτης τείνουν να είναι ήπιες και συχνά υποχωρούν τελικά μόνες τους ή με ελάχιστη παρέμβαση. Το πιο κοινό πρόβλημα είναι η δυσκοιλιότητα. Η ανάπτυξη λίθων bezoar, οι οποίες είναι μάζες που μπορούν να εμφανιστούν οπουδήποτε στο γαστρεντερικό σύστημα, είναι επίσης τυπικές επιπτώσεις. Μερικοί ασθενείς αναφέρουν επίσης ότι αισθάνονται ζάλη ή σαν να στροβιλίζονται.
Οι περισσότεροι ασθενείς που αναπτύσσουν μπεζόαρ ως αποτέλεσμα της λήψης σουκραλφάτης έχουν προδιάθεση για την πάθηση με βάση άλλους παράγοντες που συμβάλλουν. Άτομα που είχαν ή εξακολουθούν να λαμβάνουν ταυτόχρονη σίτιση με εντερικό σωλήνα κινδυνεύουν να αυξήσουν τις μάζες. Οποιαδήποτε κατάσταση καθυστερεί την κένωση του γαστρικού συστήματος είναι επίσης σε υψηλότερο κίνδυνο.
Άλλες λιγότερο συχνές παρενέργειες της σουκραλφάτης περιλαμβάνουν υπερβολικά αέρια, δυσπεψία και ξηροστομία. Μερικοί ασθενείς εμφανίζουν επίσης αχαρακτήριστη κόπωση ή αϋπνία. Έχουν υπάρξει αναφορές για πόνο στην πλάτη, ίλιγγο και πονοκεφάλους επίσης.
Πιο σοβαρές παρενέργειες της σουκραλφάτης θα πρέπει να αναφέρονται σε γιατρό το συντομότερο δυνατό. Αυτά περιλαμβάνουν έμετο ή βήχα με έντονη κόκκινη ύλη με τη συνοχή του κατακάθιου καφέ. Τα κόκκινα ή μαύρα κόπρανα είναι επίσης προβληματικά. Οποιαδήποτε σημάδια αλλεργικής αντίδρασης στο φάρμακο, συμπεριλαμβανομένου οιδήματος στις περιοχές από τον αυχένα και πάνω, αναπνευστικών προβλημάτων, κνίδωσης και σφίξιμο στο στήθος, θα πρέπει να λάβουν άμεση ιατρική φροντίδα.
Πολλές κοινές παρενέργειες της σουκραλφάτης μπορούν να μειωθούν ή να αποφευχθούν με σωστή διατροφή. Η κατανάλωση τροφών με υψηλή περιεκτικότητα σε φυτικές ίνες όπως δημητριακά ολικής αλέσεως, φρέσκα φρούτα και λαχανικά μπορεί να μειώσει τα αέρια και τη δυσκοιλιότητα. Η μεγάλη κατανάλωση υγρών, με έμφαση στο καθαρό νερό, μπορεί επίσης να είναι ευεργετική.
Η σουκραλφάτη παρέχει μια προστατευτική επένδυση για το στομάχι από δυνητικά ερεθιστικά στοιχεία όπως το οξύ και τα ένζυμα, έτσι ώστε τα τραυματισμένα μέρη της περιοχής να μπορούν να επουλωθούν. Χρησιμοποιείται πιο συχνά για τη θεραπεία ελκών. Το φάρμακο μπορεί επίσης να συνταγογραφηθεί σε ασθενείς με χημειοθεραπεία προκειμένου να θωρακιστεί το στομάχι από τις επιδράσεις της ασπιρίνης που χρησιμοποιείται για τη θεραπεία των στοματικών πληγών που σχετίζονται με τη θεραπεία.
Το φάρμακο διατίθεται σε υγρή μορφή και δισκία. Συνήθως συνταγογραφείται για αρκετές εβδομάδες, έτσι ώστε το στομάχι να έχει χρόνο να επουλωθεί. Η πιο κοινή δοσολογία είναι τέσσερις φορές την ημέρα, πριν τον ύπνο και περίπου μία ώρα πριν από τα γεύματα.
Υπάρχουν ορισμένες καταστάσεις που μπορεί να κάνουν τη λήψη σουκραλφάτης πολύ επικίνδυνη ή τουλάχιστον να απαιτούν προσαρμοσμένη δόση ή ειδική παρακολούθηση του γιατρού κατά τη διάρκεια της θεραπείας. Ο διαβήτης και οι νεφρικές ή καρδιακές παθήσεις μπορεί να είναι προβληματικές. Οι γυναίκες που θηλάζουν ή είναι έγκυες συνήθως συνιστάται να μην λαμβάνουν το φάρμακο. Η σουκραλφάτη μπορεί επίσης να έχει ανεπιθύμητη αντίδραση με αντιπηκτικά και αντιόξινα.