Η πιο κοινή αιτία της σκούρας κολπικής έκκρισης είναι η παρουσία αίματος στο έκκριμα. Στις περισσότερες περιπτώσεις, αυτό είναι φυσιολογικό και δεν αποτελεί αιτία συναγερμού. Οι γυναίκες έχουν συχνά σκούρες κολπικές εκκρίσεις στο τέλος της εμμήνου ρύσεώς τους και μερικές φορές στα μισά της περιόδου μεταξύ των περιόδων, κατά τη διάρκεια της ωορρηξίας. Είναι επίσης πιθανό οι γυναίκες να αιμορραγούν κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης, αν και αυτό μπορεί να είναι ένδειξη ότι υπάρχει πρόβλημα με την εγκυμοσύνη και η γυναίκα πρέπει να εξεταστεί από γιατρό. Σε ορισμένες περιπτώσεις, σοβαρές λοιμώξεις μπορεί να προκαλέσουν αιμορραγία από τα διάφορα όργανα του αναπαραγωγικού συστήματος, αν και η σύγχρονη ιατρική είναι συνήθως σε θέση να συλλάβει και να θεραπεύσει αυτές τις καταστάσεις πριν γίνουν τόσο σοβαρές.
Είναι πολύ συνηθισμένο για μια γυναίκα να έχει κολπικές εκκρίσεις που είναι πιο σκούρες στο τέλος κάθε εμμηνορροϊκού κύκλου. Αυτή η έκκριση αποτελείται από την επένδυση της μήτρας, η οποία αποβάλλεται μία φορά το μήνα εάν μια γυναίκα δεν μείνει έγκυος. Είναι φυσιολογικό το χρώμα και η συνοχή των υγρών της περιόδου να αλλάζουν κατά τη διάρκεια κάθε περιόδου. Το υγρό μπορεί να γίνει πιο σκούρο προς το τέλος της περιόδου επειδή το αίμα σε αυτό είναι παλαιότερο. Πολλές γυναίκες έχουν κολπικές εκκρίσεις που ποικίλλουν από βαθύ κόκκινο χρώμα σκουριάς έως καφέ ή ακόμα και μαύρο.
Η ωορρηξία μπορεί να είναι μια άλλη αιτία σκούρων εκκρίσεων. Μερικές γυναίκες εμφανίζουν ελαφρά κηλίδες καθώς το ωάριο απελευθερώνεται στη σάλπιγγα. Το χρώμα αυτής της κηλίδωσης μπορεί να κυμαίνεται από κόκκινο έως σκούρο καφέ ή μαύρο, ανάλογα με το πόσο χρόνο χρειάζεται για να ταξιδέψει μέσω της μήτρας και του κόλπου. Εφόσον η αιμορραγία είναι ελαφριά, αυτό θεωρείται φυσιολογική κατάσταση.
Η βαριά αιμορραγία που εμφανίζεται μεταξύ των περιόδων ή οποιαδήποτε αιμορραγία που εμφανίζεται ενώ μια γυναίκα είναι έγκυος θα πρέπει να αξιολογείται από γιατρό. Το χρώμα του αίματος που αποβάλλεται αυτές τις στιγμές μπορεί να είναι σκούρο ή κόκκινο και μπορεί να αποτελεί ένδειξη ότι υπάρχει πρόβλημα. Οι γυναίκες με σκούρες κολπικές εκκρίσεις κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης θα πρέπει να εξετάζονται για να διαπιστωθεί εάν ο τράχηλος της μήτρας είναι διασταλμένος, γεγονός που μπορεί να υποδηλώνει αποβολή. Όσοι έχουν συχνή αιμορραγία μεταξύ των περιόδων θα πρέπει να εξετάζονται για να διαπιστωθεί εάν η αιτία είναι μια σοβαρή ιατρική κατάσταση.
Περιστασιακά, μετά από μια ιδιαίτερα σοβαρή μόλυνση, οι κολπικές εκκρίσεις περιέχουν αίμα. Αυτό μπορεί να προκαλέσει σκούρα εκκρίσεις, αν και είναι σπάνια. Στις περισσότερες περιπτώσεις, οι κολπικές λοιμώξεις διαγιγνώσκονται και αντιμετωπίζονται πριν η λοίμωξη προχωρήσει σε σημείο που θα μπορούσε να προκαλέσει αιμορραγία.