Η θεραπεία για τη δυσλειτουργία του αυτόνομου νευρικού συστήματος στοχεύει στον εντοπισμό και τη διαχείριση μεμονωμένων συμπτωμάτων, καθώς κάθε ασθενής επηρεάζεται διαφορετικά. Μερικοί από τους πιο συνηθισμένους τύπους μεθόδων θεραπείας περιλαμβάνουν διατροφικές αλλαγές, τροποποίηση τρόπου ζωής και χρήση φαρμάκων χωρίς ιατρική συνταγή ή συνταγογραφούμενων φαρμάκων. Σε ορισμένες περιπτώσεις μπορεί να ενδείκνυται ψυχολογική θεραπεία ή συμβουλευτική. Ορισμένες σοβαρές μορφές μπορεί να απαιτούν χειρουργική επέμβαση. Οποιεσδήποτε συγκεκριμένες ερωτήσεις ή ανησυχίες σχετικά με τις καταλληλότερες μεθόδους θεραπείας για τη δυσλειτουργία του αυτόνομου νευρικού συστήματος σε μια μεμονωμένη κατάσταση θα πρέπει να συζητούνται με έναν γιατρό ή άλλο επαγγελματία ιατρό.
Η ορθοστατική υπόταση είναι ένα κοινό σύμπτωμα και περιγράφει μια ιατρική κατάσταση στην οποία η αρτηριακή πίεση πέφτει δραματικά όταν στέκεστε, προκαλώντας συχνά σοβαρούς ίλιγγους. Ενώ τα συνταγογραφούμενα φάρμακα χρησιμοποιούνται συχνά για τη θεραπεία αυτής της πάθησης, μερικές αλλαγές στον τρόπο ζωής μπορεί επίσης να βοηθήσουν. Συχνά συνιστάται στους ασθενείς να στέκονται αργά από καθιστή θέση και ενθαρρύνονται να τρώνε μικρότερα, πιο συχνά γεύματα.
Η δυσκοιλιότητα είναι ένα συχνά αναφερόμενο πρόβλημα μεταξύ των ατόμων με δυσλειτουργία του αυτόνομου νευρικού συστήματος. Αυτή η κατάσταση αντιμετωπίζεται συνήθως με μια δίαιτα πλούσια σε φυτικές ίνες και τη χρήση καθαρτικών ή μαλακτικών κοπράνων χωρίς ιατρική συνταγή. Το άγχος μπορεί να αντιμετωπιστεί με συνταγογραφούμενα φάρμακα, συμβουλευτική ή συνδυασμό των δύο. Η στυτική δυσλειτουργία μπορεί να εμφανιστεί σε άνδρες με αυτήν την πάθηση και συνήθως αντιμετωπίζεται με συνταγογραφούμενα φάρμακα.
Μειωμένη ικανότητα εφίδρωσης εμφανίζεται σε μεγάλο αριθμό ασθενών με δυσλειτουργία του αυτόνομου νευρικού συστήματος. Η αποφυγή υπερβολικά ζεστών περιβαλλόντων ή το συχνό δροσερό ντους μπορεί να είναι χρήσιμη για όσους έχουν αυτό το σύμπτωμα. Οι οφθαλμικές σταγόνες μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη θεραπεία της ξηροφθαλμίας, ενώ τα τσιπς πάγου ή οι σκληρές καραμέλες μπορούν να βοηθήσουν στη διατήρηση της λίπανσης του στόματος. Οι ασθενείς που παρουσιάζουν προβλήματα κατάποσης ή αναπνοής μπορεί να χρειαστούν χειρουργική επέμβαση για να τεντώσει τον οισοφάγο ή να ανοίξει τους αεραγωγούς.
Καρδιακά προβλήματα μπορεί να εμφανιστούν ως αποτέλεσμα αυτής της διαταραχής, μερικές φορές να γίνονται αρκετά σοβαρά ώστε να απαιτούν χειρουργική επέμβαση. Τα φάρμακα και οι διατροφικές αλλαγές μπορούν να βοηθήσουν στον έλεγχο της υψηλής αρτηριακής πίεσης στις περισσότερες περιπτώσεις. Εάν οι καρδιακές βαλβίδες ή άλλες κυκλοφορικές δομές δεν λειτουργούν σωστά, μερικές φορές καθίσταται απαραίτητη η χειρουργική αποκατάσταση.
Τα διάφορα συμπτώματα της δυσλειτουργίας του αυτόνομου νευρικού συστήματος ποικίλλουν ευρέως από τον έναν ασθενή στον άλλο και μπορεί ακόμη και να αλλάζουν περιοδικά για κάθε ασθενή ξεχωριστά. Η στενή ιατρική παρακολούθηση είναι απαραίτητη για όσους πάσχουν από αυτή τη διαταραχή, έτσι ώστε ο επιβλέπων ιατρός να μπορεί να ανιχνεύσει τυχόν αλλαγές ή αναπτυσσόμενες επιπλοκές στα πρώτα στάδια.