Το πύον συχνά προκύπτει από μόλυνση και συνήθως αποτελείται από νεκρά λευκά αιμοσφαίρια, συντρίμμια από άλλα κατεστραμμένα κύτταρα και ιστό και βακτήρια. Τα κύτταρα που ονομάζονται ουδετερόφιλα μπορούν να σκοτώσουν τους εισβολείς, αλλά συχνά σκοτώνονται στη διαδικασία. τα βακτήρια στο πύον επομένως μερικές φορές ονομάζονται πυογόνα. Αυτά είναι συχνά κόκκοι, οι οποίοι είναι σφαιρικοί οργανισμοί με παχιά κυτταρικά τοιχώματα και περιλαμβάνουν διάφορες ποικιλίες Staphylococcus και Streptococcus. Τα βακτήρια Staphylococcus epidermidis ζουν συνήθως στο δέρμα και μερικές φορές προλαμβάνουν μυκητιάσεις. Αυτά σπάνια προκαλούν ασθένεια, αλλά η ποικιλία aureus βρίσκεται συχνά σε πληγές, βράζει και σπυράκια.
Τα βακτήρια στο πύον μπορεί να είναι οργανισμοί που προκαλούν στρεπτόκοκκο λαιμό και αμυγδαλίτιδα. Οι στρεπτόκοκκοι μπορούν να παρατηρηθούν σε πολλές λοιμώξεις του δέρματος. Είναι γενικά ικανά να προκαλέσουν πυώδεις λοιμώξεις, που είναι αυτές που οδηγούν στο σχηματισμό πύου. Ορισμένες λοιμώξεις που προκαλούν αυτήν την αντίδραση μπορεί να οδηγήσουν σε ασθένειες όπως ο ρευματικός πυρετός ή τα βακτήρια μπορούν να απελευθερώσουν τοξίνες που προκαλούν σοκ ή ερυθρό πυρετό. Το αν ένα βακτήριο προκαλεί ασθένειες ή είναι ακίνδυνο εξαρτάται από τη γενετική, τη χημεία και τη δομική του σύνθεση.
Ο Streptococcus pneumoniae είναι ο οργανισμός που συνήθως προκαλεί βακτηριακή πνευμονία και μπορεί επίσης να υπάρχει σε λοιμώξεις του μέσου ωτός. Αυτά τα βακτήρια στο πύον έχουν μερικές φορές ένα εξωτερικό κέλυφος που εμποδίζει τα κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος να τα τυλίξουν και να τα σκοτώσουν. Οι ενθυλακωμένες μορφές μπορεί να αρρωστήσουν κάποιον, αλλά όταν ένα βακτήριο δεν είναι ενθυλακωμένο, συνήθως μπορεί να αφαιρεθεί από τα κύτταρα του αίματος. Αυτός ο τύπος μπορεί να ονομαστεί μη μολυσματικός επειδή δεν προκαλεί συνήθως ασθένεια.
Άλλα είδη βακτηρίων στο πύον περιλαμβάνουν το Neisseriae, το οποίο μπορεί να προκαλέσει μηνιγγίτιδα και γονόρροια. Πολλοί από αυτούς τους τύπους ζουν κανονικά στις βλέννες του σώματος, αλλά μερικές ποικιλίες μπορεί να είναι επικίνδυνες και ακόμη και θανατηφόρες. Το χρώμα του πύου μπορεί να ποικίλει από κίτρινο έως υπόλευκο-κίτρινο, έως κίτρινο-καφέ ανάλογα με τον τύπο των βακτηρίων και άλλων κυτταρικών υλικών που υπάρχουν. Ορισμένα βακτήρια έχουν χρωστικές που προκαλούν το πύον να είναι γαλαζοπράσινο και μερικά λευκά αιμοσφαίρια μπορούν να απελευθερώσουν πρωτεΐνες που σκοτώνουν τους οργανισμούς προσθέτοντας ένα ξεχωριστό πράσινο χρώμα.
Τα βακτήρια στο πύον είναι συνήθως παθογόνα. Το πύον μπορεί να σχηματιστεί τόσο στο δέρμα όσο και στο εσωτερικό του σώματος. Σκοπιάζοντας το εσωτερικό της κοιλιάς, οι χειρουργοί μπορούν να δουν λοιμώξεις οργάνων όπως το ήπαρ ή το πάγκρεας. Άλλα βακτήρια μπορούν να μολύνουν το ουροποιητικό σύστημα ή ακόμα και τους πνεύμονες. Γενικά, τα βακτήρια μπορούν να μολύνουν ένα άτομο μέσω οποιασδήποτε περικοπής στο δέρμα και το πύον συχνά παρεμβαίνει στη διαδικασία επούλωσης. μερικές φορές το αποτέλεσμα είναι σοκ, γάγγραινα ή λοιμώξεις των λεμφαδένων.