Μια μεγάλη πέτρα στα νεφρά δεν μπορεί να περάσει μέσω του ουροποιητικού συστήματος με τον τρόπο που μπορούν συνήθως οι μικρότερες, και η εξάλειψή τους συνήθως απαιτεί επεμβατικές διαδικασίες όπως η νεφροσκοπική χειρουργική. Αυτό μπορεί να αντιμετωπιστεί είτε ως εσωτερικός ασθενής στο νοσοκομείο είτε ως εξωτερικός ασθενής στο ιατρείο. Άλλες διαδικασίες για την αφαίρεση μιας μεγάλης πέτρας στα νεφρά περιλαμβάνουν την ουρητηροσκοπική αφαίρεση ή την εξωσωματική λιθοτριψία με κρουστικό κύμα.
Ενώ οι μικρές πέτρες στα νεφρά συχνά δεν προκαλούν καθόλου συμπτώματα, μια μεγάλη πέτρα στα νεφρά μπορεί να προκαλέσει σοβαρή ενόχληση. Αυτό συμβαίνει όταν η πέτρα κινείται και εμποδίζει τη ροή των ούρων. Αυτό προκαλεί οξύ πόνο ή έντονη κράμπα στην πλάτη στην πλευρά όπου βρίσκεται η πέτρα. Μπορεί να εμφανιστεί αίμα στα ούρα ως αποτέλεσμα αυτής της απόφραξης. Εάν εμφανιστεί πυρετός ή ρίγη, αυτό μπορεί να είναι σημάδι μόλυνσης από πέτρες στα νεφρά, η οποία μπορεί να αντιμετωπιστεί με αντιβιοτικά.
Η διαδερμική νεφρολιθοτομή είναι η χειρουργική επέμβαση πέτρας στα νεφρά που συχνά εκτελείται για την αφαίρεση μεγάλης πέτρας στα νεφρά. Υπό γενική αναισθησία, γίνεται μια τομή στο νεφρό με νεφροσκόπιο και αφαιρείται η πέτρα. Οι ασθενείς θα πρέπει συνήθως να παραμείνουν στο νοσοκομείο για μία ή δύο ημέρες και η πλήρης ανάρρωση από αυτή τη χειρουργική επέμβαση μπορεί να διαρκέσει μερικές εβδομάδες.
Η ουρητηροσκοπική αφαίρεση πέτρας στα νεφρά περιλαμβάνει την εισαγωγή ενός μικρού πεδίου στον ουρητήρα για τη διάσπαση μεγαλύτερων λίθων. Ένα λέιζερ μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να θρυμματίσει τις πέτρες σε μικρά κομμάτια, γεγονός που διευκολύνει την αφαίρεση. Ένας σωλήνας που ονομάζεται stent μπορεί να εισαχθεί προσωρινά για να βοηθήσει στη μείωση του οιδήματος. Αυτό γίνεται τόσο με γενική όσο και με τοπική αναισθησία, ανάλογα με τις εκάστοτε περιστάσεις.
Στην εξωσωματική λιθοτριψία με κρουστικό κύμα (SWL), τα κρουστικά κύματα χρησιμοποιούνται για να σπάσουν μια μεγάλη πέτρα στα νεφρά σε μικρότερα κομμάτια που έχουν το μέγεθος ενός κόκκου άμμου. Αυτή η μοναδική διαδικασία γίνεται ενώ ο ασθενής είναι κάτω από το νερό ή ξαπλωμένος σε ένα χοντρό μαξιλάρι και συνήθως διαρκεί λιγότερο από μία ώρα. Γίνεται με καταστολή ή με τοπική ή γενική αναισθησία. Τα κρουστικά κύματα περνούν από ολόκληρο το σώμα και διασπούν τις πέτρες στα νεφρά. Τα μικροσκοπικά κομμάτια περνούν εύκολα στα ούρα.
Οι παρενέργειες για τη θεραπεία των λίθων στα νεφρά με τη μέθοδο SWL περιλαμβάνουν αίμα στα ούρα και μώλωπες στην πλάτη και την κοιλιά. Επιπλέον, οι πολύ μεγάλες πέτρες μπορεί να απαιτούν περισσότερες από μία επεξεργασίες για να σπάσουν σε αρκετά μικρά κομμάτια. Μπορεί να χρειαστούν αρκετοί μήνες για να περάσουν όλα τα κομμάτια από το ουροποιητικό σύστημα.