Υπάρχουν δύο κυρίως διαφορετικές μπαταρίες στην οικογένεια των μπαταριών μαγγανίου: λιθίου-μαγγανίου και ψευδαργύρου-μαγγανίου. Οι μπαταρίες ψευδαργύρου-μαγγανίου, γνωστές και ως αλκαλικές μπαταρίες, περιέχουν μεγάλη ποσότητα διοξειδίου του μαγγανίου. Και οι δύο τύποι μπαταριών είναι καλοί για διαφορετικούς λόγους. Η παραλλαγή λιθίου είναι καλύτερη για μακροζωία, ενώ η αλκαλική μπαταρία είναι καλύτερη για παλαιότερα είδη και εκείνα που απαιτούν χαμηλή φόρτιση. Πολλοί παράγοντες που πρέπει να λάβετε υπόψη πριν αγοράσετε μια μπαταρία μαγγανίου είναι το είδος στο οποίο θα χρησιμοποιηθεί η μπαταρία, η τιμή, η μακροζωία και η δυνατότητα επαναφόρτισης.
Ορισμένα είδη δεν μπορούν να χρησιμοποιήσουν εξίσου καλά μπαταρίες λιθίου και αλκαλικές μπαταρίες ή ενδέχεται να μπορούν να χρησιμοποιούν μόνο έναν τύπο. Τα παλαιότερα αντικείμενα έχουν μερικές φορές πρόβλημα με τη χρήση μπαταριών λιθίου και τα αντικείμενα που χρειάζονται μεγάλη ποσότητα ενέργειας δυσκολεύονται να χρησιμοποιήσουν αλκαλικές μπαταρίες. Προτού κάποιος αγοράσει οποιονδήποτε τύπο μπαταρίας μαγγανίου, θα πρέπει να διαβάσει τις οδηγίες του αντικειμένου, οι οποίες συνήθως περιγράφουν λεπτομερώς ποιος τύπος μπαταρίας είναι καλύτερος για τη λειτουργία του.
Η τιμή της μπαταρίας μαγγανίου είναι ένας άλλος παράγοντας. Οι μπαταρίες ψευδαργύρου-μαγγανίου είναι πολύ φθηνότερες από τις αντίστοιχες μπαταρίες λιθίου. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι τα φθηνότερα υλικά πηγαίνουν στην παραγωγή αλκαλικών μπαταριών και η αλκαλική τεχνολογία υπάρχει εδώ και πολύ καιρό, επομένως είναι πιο εύκολο να παραχθεί. Οι μπαταρίες λιθίου-μαγγανίου κοστίζουν περισσότερο στην παραγωγή και, ενώ τείνουν να διαρκούν περισσότερο, η μπαταρία θα είναι πιο ακριβή.
Ενώ οι καταναλωτές μπορούν να συνεχίσουν να αγοράζουν μεγάλη ποσότητα μπαταριών, ορισμένοι θα προτιμούσαν να χρησιμοποιούν μια μπαταρία μεγαλύτερης διάρκειας. Όσον αφορά τη μακροζωία, οι μπαταρίες λιθίου είναι πολύ καλύτερες. Διαρκούν περίπου διπλάσιο ή τριπλάσιο από το χρόνο που κάνουν οι αλκαλικές μπαταρίες μαγγανίου. Οι αλκαλικές μπαταρίες χάνουν ενέργεια πολύ πιο γρήγορα, επομένως έχουν υψηλότερο ρυθμό διάβρωσης και διάσπασης, γεγονός που μπορεί να απελευθερώσει επικίνδυνο οξύ μπαταρίας σε όλο το αντικείμενο και σε όποιον το αγγίξει.
Εάν ένας καταναλωτής ψάχνει για μια επαναφορτιζόμενη μπαταρία, τότε οι μπαταρίες λιθίου είναι συνήθως καλύτερες για αυτό, αλλά όχι οι μπαταρίες λιθίου-μαγγανίου. Από τους τρεις κύριους τύπους μπαταρίας λιθίου, η έκδοση λιθίου-μαγγανίου είναι η μόνη που είναι κύρια μπαταρία ή μπαταρία που δεν μπορεί να επαναφορτιστεί. Οι άλλοι τύποι μπαταριών λιθίου κρατούν φορτίσεις περισσότερο από τις αλκαλικές μπαταρίες και μπορούν να αποθηκεύσουν την ενέργεια ακόμη και αν η μπαταρία δεν χρησιμοποιείται. Μια αλκαλική μπαταρία μαγγανίου, ενώ είναι επαναφορτιζόμενη, δεν αποθηκεύει ενέργεια όπως οι επαναφορτιζόμενες μπαταρίες λιθίου, ούτε θα διαρκέσει τόσο πολύ μετά τη φόρτισή της. Αυτό σημαίνει ότι, ενώ άλλες εκδόσεις μπαταριών λιθίου μπορεί να είναι καλύτερες στην επαναφόρτιση, η αλκαλική μπαταρία είναι η μόνη επαναφορτιζόμενη στην αρένα του μαγγανίου.