Legătura dintre mezencefal și puț este că ambele fac parte din trunchiul cerebral. Din punct de vedere fizic, mezencefalul și puțul sunt chiar deasupra și sub celălalt. Mezencefalul se află în partea superioară a trunchiului cerebral, iar puțul se află direct sub mezencefal. Totuși, diferența dintre mezencefal și puț este că îndeplinesc funcții diferite. În plus, deși mezencefalul și puțul sunt ambele părți separate ale trunchiului cerebral, puțul este de fapt și o parte a creierului posterior.
În general, funcția generală a trunchiului cerebral este de a facilita și permite comunicarea dintre creier și măduva spinării, care alcătuiesc sistemul nervos central. Mezencefalul, cunoscut și sub denumirea de mezencefal, se află între creierul anterior și puț. Ca parte a trunchiului cerebral, mijlocul creierului are responsabilitatea de a ajuta la coordonarea mesajelor dintre creier și măduva spinării. Pe lângă această funcție, mezencefalul este responsabil și pentru unele reflexe, precum și pentru unele mișcări voluntare. De exemplu, mezencefalul coordonează reflexele oculare. De asemenea, ajută la coordonarea posturii, precum și la mers.
Pons, sau metencefalul, este situat între mijlocul creierului și medulara, o altă parte a creierului posterior care alcătuiește și restul trunchiului cerebral. De asemenea, pontul conectează medulul cu cerebelul. La fel ca mijlocul creierului, puțul ajută la coordonarea transferului de mesaje în interiorul creierului, acționând ca o punte de comunicare între creier, măduva spinării și cerebel. Pons este, de asemenea, responsabil și pentru alte funcții, cum ar fi ajutarea la reglarea respirației și începerea sau terminarea impulsurilor motorii și informațiile senzoriale care sunt trimise către și de la creier și față.
Sistemul nervos central este alcătuit practic din creier și măduva spinării. Creierul trimite mesaje motorii măduvei spinării, care apoi le trimite către partea corespunzătoare a corpului. Măduva spinării, la rândul său, trimite mesaje senzoriale către creier. Această comunicare permite corpului uman să funcționeze așa cum o face, iar trunchiul cerebral joacă un rol vital în această comunicare, fără trunchiul cerebral, schimbul de informații dintre creier și corp s-ar pierde. Ca atare, este clar că mezencefalul și puțul sunt două părți mici, dar foarte importante, ale sistemului nervos central.