Zimografia este o tehnică realizată de biochimiști în care particulele sunt dispersate folosind o sarcină electrică într-un proces cunoscut sub numele de electroforeză. Mai exact, procesul folosește un substrat în care o enzimă va reacționa prin polimerizare cu un gel de policrilamidă, o soluție pe bază de apă făcută din materiale toxice. Acest gel de zimogramă este cunoscut sub numele de gel de poliacrilamidă cu dodecil sulfat de sodiu (SDS-PAGE).
Un biochimist care efectuează zimografie va pregăti gelul de zimogramă folosind metoda electroforezei. De obicei, această metodă se face împreună cu fierberea sau reducerea gelului. Cu toate acestea, în zimografie, gelul SDS-PAGE este păstrat intact. După această etapă, porțiunea SDS a compusului este îndepărtată folosind un material cunoscut sub numele de Triton X-100™, un detergent de oxidare de la compania BASF™. Acest material este păstrat la 98°F (aproximativ 37°C) pentru o perioadă de timp într-un incubator avansat. Un biochimist va colora apoi materialul rămas folosind fie un compus negru, fie albastru. Acest lucru îi permite unui cercetător să identifice unde și cum are loc digestia de către enzimele din substanță.
În timp ce gelul SDS-PAGE este substanța cel mai frecvent utilizată în zimografie, alte tipuri de material pot fi utilizate pentru a identifica viteza de digestie și capacitatea unei enzime. De multe ori, aceasta include adăugarea unui film de amidon pentru a ajuta procesul de identificare vizuală.
Biochimiștii și inginerii biomedicali folosesc de obicei acest proces în efortul de a afla despre noi forme de enzime. Prin definirea ratei de digestie și a modelelor de mișcare ale unei enzime, pot fi identificate diferitele proprietăți ale proteinelor umane și animale. Acesta este utilizat pentru anumite cercetări și analize genetice, precum și pentru aplicații de medicamente și medicamente.
Procesul de zimografie trebuie tratat cu grijă. Deși se poate face în principal cu măsuri de siguranță minime, orice om de știință sau cercetător care manipulează materialele trebuie să fie sigur că evită contactul fizic. Atât detergentul Triton X-100™ cât și gelul SDS-PAGE pot fi foarte toxice pentru piele.
Există o serie de enzime care nu răspund așa cum era de așteptat la acest proces. De exemplu, glicozidazele digestive D. melanogaster pot supraviețui proceselor de reducere în alte tipuri de examene digestive. În plus, va supraviețui procesului de încălzire până la 122 ° F (aproximativ 50 ° C), cu mult peste nivelul necesar în procesul zimografic tradițional. Când o enzimă supraviețuiește procesului fără a digera complet gelul SDS-PAGE, se observă o rezoluție crescută a benzii în etapele finale. Acest lucru poate cauza probleme cu obținerea rezultatelor corecte din procesul de zimografie.