Organismul produce mucus deoarece substanța prezintă caracteristici care îl ajută să prevină și să combată infecțiile. De asemenea, organismul îl folosește ca catalizator pentru anumite funcții de reproducere și ca lubrifiant. Lichidul pe bază de apă conține carbohidrați, săruri și proteine, toate necesare sistemelor multiple de organe. Proteinele primare sunt încapsulate într-o substanță zaharoasă care le permite să absoarbă cantități mari de apă, care produc proprietățile hidratante ale mucusului de care depinde organismul pentru homeostazie. Unele proteine sunt anticorpi care pornesc sistemul imunitar al organismului atunci când este detectat un invadator străin. Alte proteine sunt enzime antiseptice care ucid invadatorul de îndată ce acesta intră în contact cu flegma.
Corpul mediu produce peste 4 căni (1 litru) de mucus în fiecare zi. Cea mai mare parte este produsă de sistemul respirator, unde servește mai multor scopuri. Pe măsură ce aerul intră în căile nazale, mucusul prinde particule mai mari care ar înfunda căile respiratorii înguste. Dacă oricare dintre particulele care rămân prinse în flegmă este patogenă, proprietățile antiseptice și antibiotice funcționează pentru a ucide bacteriile, virusul sau ciupercile. De asemenea, ajută la hidratarea aerului inhalat, care împiedică uscarea membranelor din corp din cauza respirației.
Mucusul funcționează și ca cel mai abundent lubrifiant al organismului. După ce particulele sunt prinse în timpul respirației, corpul propulsează substanța lubrifiată, prin intermediul unor mici fire de păr în mișcare numite cili, spre stomac. În stomac, acidul poate finaliza procesul de ucidere a oricăror agenți patogeni care pot infecta celulele sănătoase. Celulele din sistemul digestiv produc, de asemenea, o cantitate mare de mucus care este folosit ca lubrifiant pentru a ajuta la propulsarea alimentelor prin esofag. Mucoasa stomacului necesită, de asemenea, un strat de lubrifiant, deoarece, în timp ce acidul este util în uciderea particulelor infecțioase, va mânca și celulele care formează mucoasa dacă nu este protejat corespunzător.
Sistemul reproducător feminin se bazează pe mucus pentru a ajuta la reglarea ciclului său. În timpul ovulației, substanța produsă este limpede și curgătoare. Lubrifiantul apos este favorabil pentru primirea și fertilizarea spermei. După ovulație, devine mai groasă, iar această substanță, care conține și mai multe proteine antibiotice, poate împiedica sperma să călătorească mai departe decât vaginul, prevenind fecundarea. Sistemul reproducător masculin îl produce împreună cu materialul seminal prin intermediul veziculelor seminale, iar acest mucus conține carbohidrați și zaharuri care hrănesc sperma în timpul ciclului său de viață.