Μια ομάδα σύνδεσης είναι μια συλλογή γονιδίων που είναι αρκετά κοντά σε ένα γονιδίωμα ώστε να κληρονομηθούν μαζί. Η μεταγραφή και η μετάφραση των γονιδίων στην ομάδα μπορεί ή όχι να συνδέονται μεταξύ τους και η ακριβής δραστηριότητά τους εξαρτάται τόσο από τον οργανισμό που κωδικοποιούν όσο και από την εγγύτητά τους μεταξύ τους. Σε απλά κύτταρα που δεν διαθέτουν πυρήνα που ονομάζεται προκαρυωτικά, τα γονίδια που αποτελούν μονάδες οπερονίου μπορούν να θεωρηθούν ομάδες σύνδεσης. Οι ευκαρυώτες, πιο πολύπλοκα κύτταρα, δεν έχουν ισοδύναμη δομική ομαδοποίηση στο γονιδίωμά τους, αλλά παρά την έλλειψη οπερονίων μπορούν να περιέχουν πολλές ομάδες σύνδεσης. Τόσο οι προκαρυώτες όσο και οι ευκαρυώτες περνούν σε ομάδες σύνδεσης σε μεγάλο βαθμό μέσω ανασυνδυασμού.
Ο ανασυνδυασμός είναι μια διαδικασία με την οποία η μεταβλητότητα μπορεί να αυξηθεί σε ένα γονιδίωμα και αποτελείται από κομμάτια δεοξυριβονουκλεϊκού οξέος (DNA) που σπάνε και επανασυνδέονται σε εντελώς νέα μέρη. Όταν μια ομάδα σύνδεσης εμπλέκεται στον ανασυνδυασμό, όλα τα γονίδια μέσα στην ομάδα τείνουν να παραμένουν μαζί, έτσι όλες οι δραστηριότητες των γονιδίων μεταφέρονται ταυτόχρονα. Αυτή η κίνηση μπορεί να είναι σε διαφορετικό σημείο στο ίδιο χρωμόσωμα ή σε διαφορετικό χρωμόσωμα συνολικά. Συνήθως, η κίνηση νουκλεϊκού οξέος με ανασυνδυασμό δεν διαταράσσει τη λειτουργία μιας ομάδας σύνδεσης. Οι ομάδες σύνδεσης μπορούν να χωριστούν κατά τη διάρκεια του ανασυνδυασμού, αλλά η πιθανότητα να συμβεί αυτό είναι αρκετά χαμηλή.
Δεδομένου ότι τα γονίδια σε μια ομάδα σύνδεσης τείνουν να παραμένουν μαζί, μπορούν επίσης να μελετηθούν μαζί. Οι ομάδες σύνδεσης μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη χαρτογράφηση ενός γονιδιώματος όσον αφορά τόσο τη δομή όσο και τη λειτουργία, εντοπίζοντας περιοχές που μπορεί να εμπλέκονται σε ασθένεια ή περιοχές που είναι εγγενώς ασταθείς λόγω της γενετικής τους σύνθεσης. Ένας αριθμός γονιδιωμάτων έχει χαρτογραφηθεί με αυτόν τον τρόπο, συμπεριλαμβανομένων πολλαπλών σημαντικών καλλιεργειών τροφίμων. Μόλις χαρτογραφηθεί μια συγκεκριμένη καλλιέργεια, ο χάρτης μπορεί να παρέχει ένα πρότυπο για επιλεκτική αναπαραγωγή για τη βελτίωση της ποιότητας ή της απόδοσης της καλλιέργειας με διάφορους τρόπους.
Η αναγνώριση της ομάδας σύνδεσης έχει πολλές εφαρμογές που σχετίζονται με την ανθρώπινη υγεία, από τον εντοπισμό γενετικών ασθενειών έως την ανάλυση των γονιδίων επικίνδυνων μικροοργανισμών ή παρασίτων. Η ανάλυση των ομάδων σύνδεσης μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τον εντοπισμό νέων γονιδίων και γονιδίων που αντιδρούν διαφορετικά σε φάρμακα ή περιβαλλοντικές πιέσεις. Γονίδια που προσδίδουν αντοχή σε φάρμακα, παθογόνα ή παράσιτα μπορούν επίσης να βρεθούν σε ομάδες σύνδεσης και ανάλογα με την περίσταση μπορούν να παρέχουν πολλούς στόχους φαρμάκων ή ευεργετικές αλληλουχίες για χρήση σε γονιδιακές θεραπείες. Η ανακάλυψη των ομάδων σύνδεσης έχει δημιουργήσει μια πληθώρα νέων ευκαιριών για την ανάλυση γενετικών αλληλουχιών και τη χρήση τους προς όφελός μας.