Ένα στρατιωτικό φαρμακείο είναι ένα φαρμακείο που καλύπτει τις ανάγκες ενός στρατιωτικού συστήματος υγειονομικής περίθαλψης, όπως το TRICARE στον στρατό των Ηνωμένων Πολιτειών. Τα στρατιωτικά φαρμακεία χορηγούν φάρμακα σε μέλη του στρατού, σε εξαρτώμενα μέλη τους και σε στρατιωτικούς συνταξιούχους. Αυτά τα φαρμακεία λειτουργούν όπως τα μη στρατιωτικά φαρμακεία, με μερικές βασικές διαφορές. Σε πολίτες με εκπαίδευση στο φαρμακείο, συμπεριλαμβανομένων πλήρως καταρτισμένων φαρμακοποιών, μπορούν να προσφερθούν μπόνους υπογραφής, στρατιωτικές εκπτώσεις και άλλα προνόμια για να ενταχθούν στο στρατό για να εργαστούν σε φαρμακείο, και άτομα χωρίς εκπαίδευση που ενδιαφέρονται για εργασία στο φαρμακείο μπορούν να λάβουν εκπαίδευση μετά τη στράτευση, εάν έχουν τα προσόντα και ο στρατός χρειάζεται προσωπικό φαρμακείου.
Όπως ένα πολιτικό φαρμακείο, ένα στρατιωτικό φαρμακείο διατηρεί σε απόθεμα μια σειρά από απαραίτητα φάρμακα, τα οποία μερικές φορές αναφέρονται σε αυτά ως “συνταγή φάρμακα”. Τα φάρμακα που αναφέρονται στη φόρμουλα που καθορίζεται από τον στρατό πρέπει να είναι διαθέσιμα στα στρατιωτικά φαρμακεία, με πολλά φαρμακεία να χρησιμοποιούν γενόσημα φάρμακα όποτε είναι δυνατόν για εξοικονόμηση κόστους. Φάρμακα εκτός του σκευάσματος μπορεί να είναι ή να μην είναι διαθέσιμα, ανάλογα με το εν λόγω φαρμακείο, και μερικές φορές μπορούν να γίνουν ειδικές ρυθμίσεις για τη μεταφορά ενός συγκεκριμένου φαρμάκου σε ένα συγκεκριμένο φαρμακείο.
Κατά γενικό κανόνα, ένα στρατιωτικό φαρμακείο λειτουργεί στο πλαίσιο του στρατιωτικού συστήματος υγειονομικής περίθαλψης. Αυτό σημαίνει ότι δέχεται μόνο συνταγές από στρατιωτικούς γιατρούς ή πολιτικούς γιατρούς που έχουν αναγνωρισμένη σχέση με το στρατιωτικό σύστημα υγειονομικής περίθαλψης. Μπορεί να βρίσκεται σε στρατιωτικό νοσοκομείο, σε βάση ή σε πλοίο και το προσωπικό εκπαιδεύεται τόσο στο γενικό πρωτόκολλο φαρμακείων όσο και στο ειδικό πρωτόκολλο για τα στρατιωτικά φαρμακεία.
Σε ένα στρατιωτικό φαρμακείο, όπως και στα μη στρατιωτικά φαρμακεία, οι συνταγές συμπληρώνονται όσο το δυνατόν πιο γρήγορα, με μέτρα που να διασφαλίζουν ότι οι συνταγές συμπληρώνονται σωστά. Αυτά τα βήματα περιλαμβάνουν έλεγχο για να επιβεβαιωθεί ότι δεν υπάρχουν συγκρούσεις με τα φάρμακα που λαμβάνει ο ασθενής, επιβεβαίωση της δόσης που συνταγογραφήθηκε από τον γιατρό και διατήρηση των συνθηκών καθαρών και οργανωμένων, ώστε όλο το προσωπικό του φαρμακείου να γνωρίζει πού να βρει πράγματα. Όταν ένας ασθενής ζητήσει μια διαβούλευση, ένας φαρμακοποιός μπορεί να παρέχει οποιεσδήποτε απαραίτητες συμβουλές και να απαντήσει σε ερωτήσεις.
Τα στρατιωτικά φαρμακεία έχουν σχεδιαστεί για να λειτουργούν σε υψηλό επίπεδο αποτελεσματικότητας ενώ προσφέρουν πολύ υψηλής ποιότητας φροντίδα. Τα φάρμακα είναι συνήθως δωρεάν ή παρέχονται με χαμηλή συνδρομή, ανάλογα με το έθνος και την κατάσταση του ασθενούς. Ωστόσο, μερικές φορές οι περιορισμοί στο φαρμακείο γίνονται περιοριστικοί. Για παράδειγμα, οι ασθενείς που χρειάζονται ένα φάρμακο με επωνυμία ενδέχεται να μην έχουν πρόσβαση σε αυτό μέσω του στρατιωτικού φαρμακείου, εάν υπάρχει διαθέσιμο ένα γενόσημο, επειδή η φόρμουλα περιλαμβάνει μόνο γενόσημα φάρμακα.