Η αερόβια κομποστοποίηση είναι η δημιουργία λιπασμάτων λίπανσης που βασίζεται σε βακτήρια που ευδοκιμούν σε περιβάλλον πλούσιο σε οξυγόνο. Είναι διαφορετικό από την αναερόβια κομποστοποίηση, η οποία βασίζεται σε βακτήρια που δεν μπορούν να ευδοκιμήσουν παρουσία οξυγόνου. Κατά γενικό κανόνα, η αερόβια κομποστοποίηση θεωρείται η ταχύτερη μέθοδος κομποστοποίησης και έχει ορισμένα πλεονεκτήματα όταν πρόκειται για τη δημιουργία ιδιαίτερα κατάλληλου κομπόστ. Η αναερόβια κομποστοποίηση είναι γνωστό ότι λειτουργεί πολύ πιο αργά, αλλά απαιτεί επίσης λιγότερη εργασία, επομένως προτιμάται από ορισμένους ανθρώπους.
Η κομποστοποίηση είναι βασικά η διαδικασία λήψης νεκρών οργανικών υλικών και συσσώρευσής τους ώστε να σαπίσουν. Με την πάροδο του χρόνου, στην πραγματικότητα μετατρέπονται σε ένα είδος γονιμοποιημένου προϊόντος εδάφους. Το πλούσιο μαύρο είδος εδάφους που χρησιμοποιείται συχνά για την καλλιέργεια φυτών είναι συνήθως κάποιο είδος κομπόστ. Τα υλικά που χρησιμοποιούνται για την παρασκευή κομπόστ ποικίλλουν αρκετά, αλλά συνήθως τα ζιζάνια, τα νεκρά φύλλα και τα αποκόμματα γρασιδιού αποτελούν μεγάλο μέρος της διαδικασίας.
Η μεγάλη διαφορά όσον αφορά τη διαδικασία εργασίας με την αερόβια κομποστοποίηση και την αναερόβια κομποστοποίηση είναι το πόσο συχνά γυρίζεται το κομπόστ. Και με τα δύο συστήματα, ένας σωρός λιπασματοποιήσιμου υλικού υγραίνεται με νερό και αφήνεται να σαπίσει για κάποιο χρονικό διάστημα. Τελικά, η θερμοκρασία της σήψης ύλης θα αυξηθεί λόγω της βακτηριακής δραστηριότητας και στη συνέχεια θα αρχίσει να πέφτει καθώς τα βακτήρια τελειώνουν από οξυγόνο και αρχίζουν να πεθαίνουν.
Μόλις τα βακτήρια αρχίσουν να πεθαίνουν στην αερόβια κομποστοποίηση, ο αγρότης θα ανακατέψει το υλικό ή θα το γυρίσει, για να πάρει περισσότερο οξυγόνο στο σωρό. Αυτό αναζωογονεί τα βακτήρια και διατηρεί τη διαδικασία σε εξέλιξη. Με την αναερόβια κομποστοποίηση, τα πάντα μένουν μόνα τους ακόμα και όταν τα πράγματα ζεσταθούν, και νέα βακτήρια θα εισβάλουν που δεν χρειάζονται οξυγόνο για να επιβιώσουν. Αυτή η προσέγγιση μερικές φορές είναι περισσότερο από δύο φορές πιο αργή και προφανώς, παράγει μια πιο δυσάρεστη οσμή.
Η θερμοκρασία του σωρού κομποστοποίησης θεωρείται σημαντικό μέρος της διαδικασίας, επειδή η θερμότητα έχει την τάση να σκοτώνει ανεπιθύμητα πράγματα στο κομπόστ, όπως σπόρους από ζιζάνια, για παράδειγμα. Η αερόβια διαδικασία παράγει σημαντικά περισσότερη θερμότητα από την αναερόβια διαδικασία, και αυτός είναι ένας από τους κύριους λόγους για τους οποίους πολλοί αγρότες προτιμούν την πρώτη. Ορισμένοι αγρότες θα χρησιμοποιήσουν επίσης μια συνδυαστική προσέγγιση όπου φεύγουν μπορεί να αφήσουν ένα σωρό λίγο περισσότερο από το επιθυμητό πριν το γυρίσουν. Αυτό επιτρέπει στα αναερόβια βακτήρια να εγκατασταθούν, αλλά όχι να καταλάβουν το σωρό. Μόλις γυρίσει το σωρό, τα αερόβια βακτήρια είναι σε θέση να αποκατασταθούν.