Η εμπορική ή βιομηχανική κομποστοποίηση είναι μεγάλης κλίμακας κομποστοποίηση που έχει σχεδιαστεί για να χειρίζεται πολύ μεγάλο όγκο οργανικών απορριμμάτων, σε αντίθεση με την ιδιωτική ή οικιακή κομποστοποίηση, η οποία χειρίζεται οργανικά απόβλητα από ένα νοικοκυριό ή μια εγκατάσταση. Το κομπόστ που παράγεται από μια εμπορική εγκατάσταση κομποστοποίησης μπορεί να πωληθεί σε αγροκτήματα και φυτώρια, να εφαρμοστεί σε δημοτικούς εξωραϊσμούς ή να πωληθεί σε ιδιώτες, ανάλογα με τον τρόπο οργάνωσης της εγκατάστασης. Με ένα αυξανόμενο ενδιαφέρον για την κομποστοποίηση, την ανακύκλωση και τη μείωση των περιβαλλοντικών επιπτώσεων της επιχειρηματικής δραστηριότητας στις αρχές του 21ου αιώνα, οι εμπορικές δραστηριότητες κομποστοποίησης επεκτάθηκαν ριζικά.
Μια τυπική εμπορική λειτουργία κομποστοποίησης συλλέγει απόβλητα από εστιατόρια, παντοπωλεία και άλλες εμπορικές εγκαταστάσεις που χειρίζονται τρόφιμα. Μπορεί επίσης να συλλέγει απορρίμματα αυλής από φυτώρια και εταιρείες εξωραϊσμού. Ορισμένοι εμπορικοί κομποστοποιητές χειρίζονται κάδους πράσινων απορριμμάτων από μεμονωμένους πολίτες, επίσης, με τους ανθρώπους να βάζουν τα υπολείμματα της αυλής και των τροφίμων σε ένα ξεχωριστό δοχείο και να το βάζουν για τακτική συλλογή μαζί με τα σκουπίδια και την ανακύκλωση. Ορισμένες εμπορικές εγκαταστάσεις κομποστοποίησης συνεργάζονται με τις δημοτικές υπηρεσίες απορριμμάτων και ανακύκλωσης για να διευκολύνουν τους ανθρώπους να επωφεληθούν από τις υπηρεσίες του κομποστοποιητή, ενώ άλλες ιδιωτικοποιούνται.
Η συλλογή των απορριμμάτων πραγματοποιείται με ένα στόλο φορτηγών που παραδίδουν το υλικό σε κεντρική εγκατάσταση για κομποστοποίηση. Ορισμένες εμπορικές εταιρείες κομποστοποίησης επιτρέπουν επίσης στους ανθρώπους να απορρίπτουν κομπόστ, συνήθως με τη μορφή μεγάλων φορτηγών από αγροκτήματα και γεωργικές εγκαταστάσεις. Ο τεράστιος όγκος των απορριμμάτων απαιτεί πολύ χώρο για κομποστοποίηση και είναι ιδανικό για αναερόβια κομποστοποίηση, στην οποία το κομπόστ διασπάται γρήγορα από αναερόβιους οργανισμούς που παράγουν τεράστια θερμότητα ως απόβλητο προϊόν.
Όταν γίνεται καλή διαχείριση, μια εμπορική εγκατάσταση κομποστοποίησης δεν πρέπει να δημιουργεί οσμή, είτε είναι αναερόβια είτε αερόβια. Οι υπάλληλοι διαχειρίζονται το κομπόστ, γυρίζοντας ή περιστρέφοντάς το ανάλογα με τις ανάγκες και επεξεργάζονται το έτοιμο κομπόστ προς πώληση ή διανομή. Τα μέλη του προσωπικού μπορούν επίσης να τροποποιήσουν το κομπόστ, προσθέτοντας υλικά όπως άχυρο και άχυρο στο κομπόστ για να προωθήσουν την ταχεία και ομοιόμορφη διάσπαση και παρακολουθούν την υγεία των στοίβων κομποστοποίησης με εργαλεία όπως αισθητήρες θερμοκρασίας και ανιχνευτές που μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την άντληση δειγμάτων των βακτηρίων μέσα στο κομπόστ.
Το κομπόστ που παράγεται σε μια εμπορική εγκατάσταση μπορεί να είναι πολύ υψηλής ποιότητας, ειδικά εάν το προσωπικό είναι ευσυνείδητο σχετικά με το χειρισμό και τη διαλογή του κομπόστ του. Στην περίπτωση δημοτικής υπηρεσίας, το κομπόστ μπορεί να χρησιμοποιηθεί στον εξωραϊσμό της πόλης ή να διανεμηθεί δωρεάν στους πολίτες που το ζητούν. Οι ιδιωτικοποιημένες εταιρείες τείνουν να πωλούν το κομπόστ τους ή συνάπτουν συμφωνίες συνεργασίας με αγροκτήματα που προμηθεύουν ακατέργαστα οργανικά απόβλητα και λαμβάνουν τελικό κομπόστ σε αντάλλαγμα.
Σε ορισμένες πόλεις, η εμπορική κομποστοποίηση έχει ξεκινήσει ως μια εθελοντική οργανωμένη προσπάθεια πολιτών που θέλουν να προωθήσουν την κομποστοποίηση. Με την πάροδο του χρόνου, πολλοί από αυτούς τους συνεταιρισμούς δωρεάν κομποστοποίησης έχουν μετατραπεί σε εμπορικές δραστηριότητες, ως απάντηση στην αυξανόμενη ζήτηση για υπηρεσίες κομποστοποίησης.