Η ανοσοτροποποιητική θεραπεία αποτελείται από μια σειρά τριών τύπων θεραπειών για ασθένειες που μαστίζουν το ανθρώπινο ανοσοποιητικό σύστημα και αναφέρεται συχνότερα ως απλώς ανοσοθεραπεία. Οι τρεις τύποι στρατηγικών ανοσοτροποποιητικής θεραπείας περιλαμβάνουν τη χρήση ανοσοκατασταλτικών φαρμάκων για τη μείωση της φυσικής δράσης του ανοσοποιητικού συστήματος ή τη χρήση ανοσοδιεγερτικών φαρμάκων για την ενίσχυση της απόκρισής του και τη χρήση ανεκτικών ουσιών που ρυθμίζουν το ανοσοποιητικό σύστημα να ανέχεται ιστούς όπως αυτός μεταμοσχευμένων οργάνων. Κάθε κατηγορία θεραπειών προορίζεται για συγκεκριμένα προβλήματα του ανοσοποιητικού συστήματος. Τα ανοσοκατασταλτικά φάρμακα και τα ανεκτικά χρησιμοποιούνται μαζί για τη θεραπεία αυτοάνοσων ασθενειών όπως η σκλήρυνση κατά πλάκας (ΣΚΠ) και οι μεταμοσχεύσεις οργάνων όπου το σώμα επιτίθεται στον ιστό του. Χορηγούνται ανοσοδιεγερτικά φάρμακα για την ενίσχυση του ανοσοποιητικού συστήματος σε περιπτώσεις που αυτό είναι εξασθενημένο, όπως με καρκίνο, AIDS και άλλες απειλητικές για τη ζωή λοιμώξεις.
Σε περιπτώσεις όπου η ανοσοτροποποιητική θεραπεία χρησιμοποιείται σε ανοσοκατασταλτικό ρόλο, η ίδια η θεραπεία μπορεί να λειτουργήσει κάπως στο σκοτάδι. Με τη σκλήρυνση κατά πλάκας, λίγα είναι ακόμα κατανοητά για την παθογένεση ή την έναρξη και την ανάπτυξη της νόσου με την πάροδο του χρόνου. Ο ρόλος της ίδιας της ανοσοτροποποιητικής θεραπείας στην ανακούφιση ορισμένων ατόμων που πάσχουν από μια τέτοια κατάσταση είναι επίσης ελάχιστα κατανοητός, αλλά η θεραπεία ήταν η μόνη διαθέσιμη μέθοδος που υπάρχει για να βοηθήσει ασθενείς με ΣΚΠ από το 2004. Λόγω των πλεονεκτημάτων που προσφέρει σε χρόνια άρρωστοι ασθενείς, ανοσοτροποποιητική θεραπεία που αποτελείται από τέσσερα ανοσοτροποποιητικά φάρμακα και ένα ανοσοκατασταλτικό φάρμακο χορηγείται σε ασθενείς στις ΗΠΑ από το 1993. Οι θεραπείες έχουν εγκριθεί από τον Οργανισμό Τροφίμων και Φαρμάκων των ΗΠΑ (FDA), αν και η πλήρης κατανόηση του τρόπου δράσης τους είναι ασαφής .
Τόσο με τις ανοσοδιεγερτικές όσο και με τις ανοσοκατασταλτικές θεραπείες, η προϋπόθεση είναι ότι οι ευρείες επιδράσεις στο ανοσοποιητικό σύστημα συνολικά θα έχουν ένα γενικά χρήσιμο αποτέλεσμα στη θεραπεία οποιασδήποτε πάθησης υπάρχει. Η ιδέα είναι ότι τέτοια φάρμακα ανοσοτροποποιητικής θεραπείας διεγείρουν μη ειδικά τη δράση του ανθρώπινου ανοσοποιητικού συστήματος, παρόλο που οι γιατροί και οι ερευνητές δεν μπόρεσαν να εντοπίσουν άμεσα αποτελέσματα αιτίας και αποτελέσματος από τις θεραπείες από το 2011. Η υποστήριξη για τη συνέχιση τέτοιων θεραπειών μέχρι σήμερα ήταν βασίζεται εξ ολοκλήρου σε εμπειρικά στοιχεία ή στοιχεία εμπειρίας και παρατήρησης στο πεδίο από επαγγελματίες ιατρούς χωρίς ενδελεχή επιστημονικά δεδομένα και θεωρίες που να υποστηρίζουν τις υποθέσεις τους.
Λόγω αυτής της εμπειρικής προσέγγισης με την ανοσοτροποποιητική θεραπεία, υπήρξε κάποια διαμάχη στον ιατρικό τομέα ως προς το εάν τέτοιες προσεγγίσεις είναι πραγματικά δικαιολογημένες. Αυτό ισχύει ιδιαίτερα στην περίπτωση θεραπείας λοιμώξεων με ζώα συντροφιάς, όπως υποτροπιάζουσες δερματικές παθήσεις, όπου συνταγογραφούνται ανοσοδιεγερτικά φάρμακα. Τέτοιες καταστάσεις μπορεί να έχουν υποκείμενες αιτίες που δεν βασίζονται σε δυσλειτουργία του ανοσοποιητικού συστήματος. Εάν η θεραπεία ανασταλεί, η κατάσταση μπορεί να επανέλθει, επομένως, και ο κύκλος θα πρέπει να συνεχιστεί ξανά, καθώς δεν προκλήθηκε από ανοσοανεπάρκεια εξαρχής.