Πρωτοπαθείς ασθένειες ανοσοανεπάρκειας είναι εκείνες στις οποίες κάποιο μέρος του ανοσοποιητικού συστήματος είναι δυσλειτουργικό ή απουσιάζει εντελώς. Για να θεωρηθεί πρωτοπαθής μια διαταραχή του ανοσοποιητικού συστήματος, η ίδια η δυσλειτουργία του ανοσοποιητικού πρέπει να είναι η υποκείμενη αιτία της νόσου. Αυτό σημαίνει, για παράδειγμα, ότι η δυσλειτουργία του ανοσοποιητικού δεν μπορεί να έχει προκληθεί από φάρμακα ή άλλες διαταραχές. Κατά συνέπεια, η πλειονότητα των πρωτογενών διαταραχών του ανοσοποιητικού είναι γενετικές διαταραχές που διαγιγνώσκονται σε πολύ μικρά παιδιά.
Στους περισσότερους τύπους πρωτοπαθούς διαταραχής ανοσοανεπάρκειας, τα κύρια συμπτώματα είναι αποτέλεσμα της ίδιας της δυσλειτουργίας του ανοσοποιητικού. Ωστόσο, υπάρχουν διάφοροι τύποι πρωτοπαθούς ανοσολογικής διαταραχής και τα συμπτώματα μπορεί να διαφέρουν κάπως. Οι πρωτογενείς διαταραχές του ανοσοποιητικού συστήματος διαφέρουν ως προς το τμήμα του ανοσοποιητικού συστήματος που είναι δυσλειτουργικό και αυτό επηρεάζει το είδος των συμπτωμάτων που εμφανίζονται.
Περίπου οι μισές από τις πρωτοπαθείς διαταραχές ανοσοανεπάρκειας προκαλούνται από έλλειψη λειτουργικών αντισωμάτων. Ένα παράδειγμα είναι η x-συνδεδεμένη αγαμμασφαιριναιμία, γνωστή και ως XLA. Αυτή η συνδεδεμένη με χ υπολειπόμενη διαταραχή επηρεάζει τα αρσενικά παιδιά, ενώ οι γυναίκες με το ελαττωματικό γονίδιο είναι φορείς. Τα παιδιά που γεννιούνται με XLA προστατεύονται για τους πρώτους μήνες της ζωής τους από αντισώματα που παρέχονται από τη μητέρα τους στη μήτρα και στο μητρικό γάλα. Μόλις εξαφανιστεί αυτή η προστασία, αρχίζουν να υποφέρουν από επαναλαμβανόμενες βακτηριακές λοιμώξεις και κινδυνεύουν επίσης από δευτερογενείς επιπλοκές όπως η μηνιγγίτιδα.
Αντίθετα, η χρόνια κοκκιωματώδης νόσος είναι ένας τύπος πρωτοπαθούς νόσου ανοσοανεπάρκειας που προκαλείται από την αδυναμία των φαγοκυττάρων να σκοτώσουν τους οργανισμούς μετά την κατάποσή τους. Τα παιδιά με αυτή τη διαταραχή υποφέρουν από επαναλαμβανόμενες λοιμώξεις πολύ συγκεκριμένων τύπων. Ειδικότερα, είναι ευάλωτα σε πνευμονία, δερματικά αποστήματα και δερματικές λοιμώξεις και λοιμώξεις του μυελού των οστών και του αίματος.
Ένας άλλος τύπος πρωτογενούς ανοσοανεπάρκειας επηρεάζει τον καταρράκτη του συμπληρώματος, μια μοριακή αλυσιδωτή αντίδραση που πυροδοτείται από βακτηριακή μόλυνση και έχει ως αποτέλεσμα το σχηματισμό πρωτεϊνών συμπληρώματος. Αυτά τα μόρια, σε συνδυασμό με αντισώματα, βοηθούν στην εξόντωση των βακτηρίων που εισβάλλουν. Ο καταρράκτης του συμπληρώματος από μόνος του είναι ένα σχετικά μικρό μέρος του ανοσοποιητικού συστήματος, και ως εκ τούτου πολλοί άνθρωποι δεν διαγιγνώσκονται με ανεπάρκεια συμπληρώματος παρά μόνο αφού ενηλικιωθούν. Τα άτομα με αυτό το είδος ανοσοανεπάρκειας διατηρούν πλήρως λειτουργικά Τ κύτταρα και Β κύτταρα και προστατεύονται από τις περισσότερες λοιμώξεις. Σε ορισμένες περιπτώσεις, μπορεί να είναι ευάλωτα σε ορισμένους τύπους ασθενειών, συμπεριλαμβανομένων των αιματογενών λοιμώξεων.
Υπάρχουν οκτώ διαφορετικές κατηγορίες πρωτοπαθών ανοσολογικών διαταραχών και περισσότερες από 120 διαφορετικές καταστάσεις που εμπίπτουν σε μία από αυτές τις κατηγορίες. Κάθε κατηγορία διαταραχής τείνει να απαιτεί διαφορετική θεραπεία, λόγω της συμμετοχής διαφορετικών τμημάτων του ανοσοποιητικού συστήματος. Το XLA, για παράδειγμα, αντιμετωπίζεται επιτυχώς με τακτικές δόσεις προστατευτικών αντισωμάτων για την ενίσχυση της παθητικής ανοσίας στη μόλυνση. Η χρόνια κοκκιωματώδης νόσος αντιμετωπίζεται συχνά με προφυλακτικά αντιβιοτικά, ενώ ορισμένοι τύποι ανεπάρκειας συμπληρώματος δεν απαιτούν καμία θεραπεία.
Πολύ σοβαρές διαταραχές του ανοσοποιητικού μπορούν να αντιμετωπιστούν με μεταμοσχεύσεις βλαστοκυττάρων. Αυτή η θεραπεία συνήθως προορίζεται για ασθένειες όπως η σοβαρή συνδυασμένη ανοσοανεπάρκεια. Τα άτομα με αυτή τη διαταραχή δεν έχουν λειτουργικά Τ κύτταρα ή Β κύτταρα και είναι ευάλωτα σε σχεδόν όλους τους τύπους λοιμώξεων. Άλλοι τύποι πρωτοπαθούς ανοσοανεπάρκειας μπορούν να αντιμετωπιστούν με αυτόν τον τρόπο, συμπεριλαμβανομένου του XLA, αλλά η θεραπεία με βλαστοκύτταρα δεν πραγματοποιείται συχνά σε άτομα με XLA, εκτός εάν αποτύχουν άλλες θεραπευτικές επιλογές.