Η συμβατική σοφία προτείνει ότι ο καλύτερος τρόπος για την πρόληψη της ασθένειας είναι η ελαχιστοποίηση της έκθεσης ή η ανοσοποίηση πριν από μια πιθανή έκθεση. Δεν έχουν όλες οι ασθένειες εμβόλια που τις αποτρέπουν και μερικές φορές η έκθεση δεν μπορεί να ελαχιστοποιηθεί. Για ορισμένες καταστάσεις υπάρχει ένα δεύτερο μέτωπο θεραπείας που ονομάζεται προφύλαξη μετά την έκθεση ή PEP. Οι θεραπείες που εμπίπτουν σε αυτή την κατηγορία μπορούν να χορηγηθούν μετά την έκθεση, αλλά πριν από την εμφάνιση ασθένειας. Η ελπίδα είναι να προληφθεί η ασθένεια, μετά την έκθεση, με θεραπεία.
Υπάρχουν διάφοροι τύποι προφύλαξης μετά την έκθεση και ένα είδος μπορεί να είναι οικείο σε πολλούς ανθρώπους. Όσοι έχουν λάβει ποτέ ανοιχτό τραύμα και έκαναν εμβόλιο τετάνου, ως μέρος της θεραπείας, έχουν βιώσει PEP. Ένα άλλο παράδειγμα αυτού ήταν ιδιαίτερα σημαντικό το 2009, όταν οι άνθρωποι υποβλήθηκαν σε εμβολιασμούς κατά του H1N1 αφού είχαν άμεση επαφή με κάποιον που ήταν άρρωστος με τη νόσο, μειώνοντας σημαντικά τον αριθμό των κρουσμάτων. Μερικές φορές οι άνθρωποι που δεν έχουν λάβει άλλα είδη εμβολίων κατά της γρίπης λαμβάνουν ένα όταν αντιληφθούν ότι έχουν έρθει σε επαφή με κάποιον με γρίπη.
Πιθανώς ένας από τους πιο σημαντικούς τύπους προφύλαξης μετά την έκθεση αναπτύχθηκε ως απάντηση στην πιθανότητα άμεσης επαφής με τα υγρά κάποιου με HIV. Αυτό μπορεί να οφείλεται σε σεξ χωρίς προστασία ή μέσω βελονών στο ιατρικό περιβάλλον. Υπάρχει πλέον πρωτόκολλο προφύλαξης μετά την έκθεση, συμπεριλαμβανομένης της χρήσης αντιιικών φαρμάκων για αρκετούς μήνες. Αυτό μπορεί πολύ συχνά να αποτρέψει τη συστολή του HIV, αν και δεν λειτουργεί πάντα.
Πρόσθετες ασθένειες που μπορεί να προτείνουν τη χρήση προφύλαξης μετά την έκθεση περιλαμβάνουν την ηπατίτιδα Β. Αυτό έχει γίνει λιγότερο συχνό καθώς τα εμβόλια κατά της ηπατίτιδας Β αποτελούν πλέον μέρος του τακτικού προγράμματος εμβολίων για τα παιδιά. Το PEP θα συνεχίσει να συνιστάται για άτομα με αυτοάνοσες παθήσεις ή που δεν έλαβαν τα εμβόλια ως παιδιά.
Το PEP ήταν επίσης εξαιρετικά χρήσιμο στη θεραπεία της έκθεσης στη λύσσα. Σχεδόν όλοι οι άνθρωποι που γνωρίζουν ή υποψιάζονται ότι έχουν εκτεθεί έχουν συνολικά πέντε εμβόλια λύσσας που ουσιαστικά πάντα προλαμβάνουν τη νόσο, εάν χορηγηθούν μέσα σε ένα συγκεκριμένο χρονικό διάστημα. Αυτά τα πλάνα έχουν βελτιωθεί ευτυχώς. Οι άνθρωποι μπορεί να θυμούνται εφιαλτικές ιστορίες πυροβολισμών που δόθηκαν στο στομάχι και που πονούσαν πολύ άσχημα. Οι σημερινές βολές γίνονται στους μύες στον ώμο, και παρόλο που είναι ακόμα άβολες, αποτρέπουν τον θάνατο από μια καταστροφική ασθένεια.
Μια άλλη μορφή PEP, η οποία μπορεί να προκαλέσει μεγαλύτερη διαμάχη, δεν προλαμβάνει τη νόσο. Αντίθετα, μπορεί να αποτρέψει τη σύλληψη. Το χάπι της επόμενης μέρας είναι μετά από τον έλεγχο των γεννήσεων, που όταν λαμβάνεται λίγο μετά τη σεξουαλική επαφή, μπορεί να μειώσει τις αλλαγές της εγκυμοσύνης. Δεν είναι εκτρωτικό και δεν είναι πιθανό να οδηγήσει σε θάνατο ωαρίου που έχει ήδη εμφυτευθεί. Μια πρόσθετη μέθοδος που εφαρμόστηκε και εξακολουθεί να εφαρμόζεται σε κάποιο βαθμό είναι η διενέργεια D&C, συνήθως αμέσως μετά τον βιασμό μιας γυναίκας.