Η υγρομυκίνη Β είναι ένα αντιβιοτικό που χρησιμοποιείται στην ανασυνδυασμένη κλωνοποίηση για την επιλογή κυττάρων που έχουν μετασχηματιστεί με μια επιθυμητή αλληλουχία DNA. Δρα για να σκοτώσει τα μη μετασχηματισμένα, ευαίσθητα κύτταρα αναστέλλοντας την πρωτεϊνοσύνθεση. Αυτή η ένωση μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε καλλιέργειες βακτηρίων, μυκήτων, φυτών και θηλαστικών. Παράγεται από τον ακτινομύκητα Streptomyces hygroscopicus που κατοικεί στο έδαφος, η υγρομυκίνη Β προστίθεται επίσης στις πρώτες ύλες για το κοτόπουλο και τους χοίρους για να μην προσβληθούν από παράσιτα όπως τα σκουλήκια.
Οι ακτινομύκητες είναι ένας τύπος βακτηρίων που είναι κοινοί κάτοικοι του εδάφους. Παράγουν μια ποικιλία φυσικών προϊόντων που είναι τοξικά για άλλους οργανισμούς για να τους βοηθήσουν να ανταγωνιστούν και να επιβιώσουν στο έδαφος. Πολλοί διαφορετικοί τύποι αντιβιοτικών έχουν απομονωθεί από αυτούς τους οργανισμούς, συμπεριλαμβανομένης της στρεπτομυκίνης και της ακτινομυκίνης. Η Hygromycin B ανακαλύφθηκε το 1953. Αν και τοξική για τον άνθρωπο, οι πρώτες της χρήσεις ήταν να αυξήσει την τροφή των πουλερικών και των χοίρων για την πρόληψη της προσβολής από σκουλήκια.
Η υγρομυκίνη Β είναι ένα παράδειγμα της κατηγορίας των αμινογλυκοσιδικών αντιβιοτικών. Αποτελείται από σάκχαρα που έχουν αμινομάδες πάνω τους. Πολλά διαφορετικά είδη βακτηρίων έχουν βρεθεί ότι έχουν αντοχή σε αυτό το αντιβιοτικό. Αυτή η αντίσταση ενεργοποιείται με τη μεταφορά μιας φωσφορικής ομάδας σε μια ομάδα υδροξυλίου-ΟΗ-στο μόριο του αντιβιοτικού. Η πρωτεΐνη που εκτελεί αυτή την αντίδραση είναι γνωστή ως υγρομυκίνη Β φωσφοτρανσφεράση (Hph).
Ο μηχανισμός δράσης της υγρομυκίνης Β είναι η αναστολή της πρωτεϊνικής σύνθεσης επηρεάζοντας τη μετάφραση του αγγελιοφόρου RNA (mRNA). Οι πρωτεΐνες αποτελούνται από μακριές αλυσίδες αμινοξέων. Κανονικά, τα ριβοσώματα κινούνται κατά μήκος μιας αλυσίδας mRNA και παράγουν ένα αμινοξύ σύμφωνα με μια ομάδα τριών βάσεων mRNA που είναι γνωστή ως κωδικόνιο. Όταν υπάρχει το αντιβιοτικό, τα ριβοσώματα δεν διαβάζουν σωστά το κωδικόνιο και μεταφράζουν λάθος. Γενικά, αυτό έχει ως αποτέλεσμα τον τερματισμό της πρωτεϊνοσύνθεσης.
Με την έλευση της τεχνολογίας ανασυνδυασμένου DNA, οι επιστήμονες μπόρεσαν να κλωνοποιήσουν τα γονίδια Hph από πολλούς διαφορετικούς τύπους βακτηρίων. Ένας τύπος γονιδίου βρέθηκε στον ακτινομύκητα που παράγει το αντιβιοτικό και άλλος βρέθηκε στα gram αρνητικά βακτήρια Escherichia coli (E. coli) και Klebsiella pneumoniae. Δεδομένου ότι το E. coli υφίσταται τόσο συχνά χειρισμό στη γενετική μηχανική, το γονίδιο του είναι αυτό που χρησιμοποιείται πιο συχνά σε πειράματα. Ο τρόπος δράσης αυτού του αντιβιοτικού είναι διαφορετικός από αυτόν πολλών άλλων, επιτρέποντάς του να χρησιμοποιείται συχνά σε συνδυασμό με έναν επιπλέον τύπο αντιβιοτικού.
Αυτό το γονίδιο αντίστασης στην υγρομυκίνη Β χρησιμοποιείται ευρέως ως επιλέξιμος δείκτης κατά τη διάρκεια πειραμάτων κλωνοποίησης. Έτσι, χρησιμοποιείται σε ένα ανασυνδυασμένο πλασμίδιο που περιέχει επίσης ένα γονίδιο που οι επιστήμονες επιθυμούν να εισαγάγουν σε έναν οργανισμό όπως ένας μύκητας ή μια φυτική κυτταρική σειρά. Μόνο λίγα κύτταρα σε ένα μεγάλο μείγμα κυττάρων θα έχουν γενικά το επιθυμητό πλασμίδιο. Όταν ένα αντιβιοτικό προστίθεται στο κυτταρικό μείγμα, θα σκοτώσει τα ευαίσθητα κύτταρα που δεν προσέλαβαν το ανασυνδυασμένο πλασμίδιο. Αυτή η επιλογή υγρομυκίνης Β διασφαλίζει ότι τα υπόλοιπα κύτταρα θα συνεχίσουν να περιέχουν το γονίδιο που μας ενδιαφέρει.