Στην επιστήμη, ένας πρότυπος οργανισμός είναι ένας οργανισμός που χρησιμοποιείται συχνά για μελέτες και πειράματα και μπορεί να θεωρηθεί αντιπροσωπευτικό παράδειγμα μιας κατηγορίας οργανισμών ή να έχει μια ιδιαίτερα ενδιαφέρουσα ή εύκολα μελετήσιμη φυσιολογία ή ψυχολογία. Οι οργανισμοί-μοντέλοι επιλέγονται επίσης για ευκολία και γρήγορη αναπαραγωγή. Παραδείγματα περιλαμβάνουν το βακτήριο Escherichia coli, το νηματώδες Caenorhabditis elegans, τις μύγες των φρούτων (Drosophila melanogaster), τους αλμπίνο καφέ αρουραίους (Rattus norvegicus, αποκαλούμενοι επίσης «αρουραίοι εργαστηρίου»), τα ποντίκια (Mus musculus) και τους ανθρώπους (Homo sapiens). Αυτή είναι μόνο μια σύντομη λίστα – συνολικά, υπάρχουν πολλές δεκάδες οργανισμοί-μοντέλοι, από ιούς μέχρι μύκητες μέχρι φυτά και τόσο ασπόνδυλα όσο και σπονδυλωτά.
Πρότυποι οργανισμοί έχουν διδάξει στους επιστήμονες, και κατ’ επέκταση, στην ανθρώπινη φυλή, τεράστια ποσά για τη βιολογία και την ψυχολογία. Λόγω των μοντέλων οργανισμών, γνωρίζουμε ότι οι εγκέφαλοι αποτελούνται από νευρώνες, τα σώματα λειτουργούν με καθαρά μηχανικό τρόπο (αντί να κινούνται από μια «ζωτική δύναμη», όπως υποστήριξε ο Henri Bergson το 1907), πώς λειτουργεί κάθε όργανο με μεγάλη λεπτομέρεια και πώς οι ασθένειες και οι μεταλλάξεις επηρεάζουν το σώμα.
Προς απογοήτευση των ακτιβιστών για τα δικαιώματα των ζώων, οι οργανισμοί-πρότυποι μερικές φορές κακοποιούνται ή βασανίζονται εκτενώς από βίαιους πειραματισμούς. Πολλά ιδρύματα ανταποκρίθηκαν πειραματίζοντας σε οργανισμούς κατώτερου μοντέλου ή χρησιμοποιώντας προσομοιώσεις υπολογιστή όταν είναι δυνατόν, διεξάγοντας πιο ανθρώπινα πειράματα και απέχοντας από πειράματα σε οργανισμούς ανώτερων μοντέλων, εκτός εάν απαιτείται απολύτως.
Η πολυπλοκότητα του υπό εξέταση οργανισμού αποτελεί συνήθως ένδειξη για το τι χρησιμοποιείται για τη μελέτη. Για παράδειγμα, τα νηματώδη είναι πολύ απλοί πολυκύτταροι οργανισμοί και χρησιμοποιούνται συχνά για τη μελέτη των βασικών στοιχείων της φυσιολογίας, όπως ο τρόπος με τον οποίο ο εγκέφαλος κατευθύνει τα μέρη του σώματος. Το υπερθετικό παράδειγμα αυτού είναι το νηματώδες C. elegans, το οποίο έχει μελετηθεί τόσο εκτενώς, οι επιστήμονες γνωρίζουν πού πηγαίνει κάθε κύτταρο στο σώμα του και πώς αυτά τα κύτταρα αναπτύσσονται και διαφοροποιούνται κατά τη διαδικασία της εμβρυογένεσης. Πιο πολύπλοκα ζώα, όπως οι γάτες ή οι αρουραίοι, χρησιμοποιούνται για πιο σύνθετες μελέτες, όπως μελέτες όρασης ή διακριτικά ψυχολογικά χαρακτηριστικά.