Το αντισηπτικό σαπούνι, που μερικές φορές ονομάζεται αντιβακτηριακό ή αντιμυκητιακό σαπούνι, είναι κανονικό σαπούνι σε υγρή ή στερεή μορφή που περιέχει κάποιο είδος συστατικού που μειώνει την πιθανότητα μόλυνσης όταν εφαρμόζεται στο δέρμα. Αυτά τα προϊόντα έχουν επίσης αντιμικροβιακές ιδιότητες, που σημαίνει ότι σκοτώνουν ή αναστέλλουν την ανάπτυξη μικροβίων όπως βακτήρια, ιοί ή μύκητες. Το αλκοόλ, η τρικλοζάνη και το τετρανάτριο EDTA είναι τρία αντισηπτικά που χρησιμοποιούνται συνήθως στο σαπούνι και είναι όλα παραδείγματα αντιβακτηριακών αντισηπτικών, που σημαίνει ότι είναι αποδεδειγμένα αποτελεσματικά κατά των βακτηρίων.
Άλλα αντισηπτικά έχουν αντι-ιικές ιδιότητες και μερικά είναι αντιμυκητιακά και μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τη θεραπεία ή την πρόληψη μυκητιασικών λοιμώξεων όπως το πόδι του αθλητή, η δακτυλίτιδα ή οι κολπικές μολύνσεις ζύμης. Πολλά αντισηπτικά έχουν συνδυασμό αυτών των διαφόρων ιδιοτήτων. Ορισμένα αιθέρια έλαια, όπως το έλαιο δέντρου τσαγιού, περιέχουν φυσικά αντισηπτικά που ονομάζονται τερπένια και έχουν αντιβακτηριακές, αντιμυκητιακές και αντιικές ιδιότητες. Αυτά τα διάφορα είδη αντισηπτικών συστατικών χρησιμοποιούνται επίσης στο σαπούνι.
Το κανονικό σαπούνι έχει επίσης αντισηπτικές ιδιότητες από μόνο του. Το καθαρό σαπούνι παρασκευάζεται χρησιμοποιώντας κάποιο είδος ζωικού ή φυτικού λίπους που επεξεργάζεται με ένα αλκαλικό διάλυμα, συνήθως αλισίβα. Το σαπούνι καθαρίζει και απολυμαίνει κάνοντας τα έλαια να διαλύονται στο νερό, αφαιρώντας έτσι βρωμιά και υπολείμματα καθώς και διάφορα μικρόβια που υπάρχουν στο δέρμα. Αρκετές επιστημονικές μελέτες έχουν δείξει ότι το πλύσιμο των χεριών με κανονικό σαπούνι και νερό κατά το τρίψιμο των χεριών για 15 δευτερόλεπτα αφαιρεί τόσα βακτήρια και άλλους μικροοργανισμούς όσο το αντισηπτικό σαπούνι που περιέχει τρικλοζάνη. Αυτές οι δοκιμές έγιναν χρησιμοποιώντας κοινώς διαθέσιμα σαπούνια με σχετικά χαμηλά επίπεδα τρικλοζάνης, επομένως τα αποτελέσματα ενδέχεται να μην ισχύουν για προϊόντα που περιέχουν περισσότερη τρικλοζάνη ή για σαπούνια που παρασκευάζονται με άλλα αντισηπτικά συστατικά.
Ορισμένοι επιστήμονες και επαγγελματίες του ιατρικού τομέα επικρίνουν την αυξανόμενη χρήση αντισηπτικού σαπουνιού και την προσθήκη αντιβακτηριακών συστατικών σε τόσα πολλά προϊόντα καθαρισμού. Πιστεύουν ότι αυτή η πρακτική μπορεί να οδηγήσει σε περισσότερα στελέχη βακτηρίων να γίνουν ανθεκτικά στους αντιβακτηριακούς παράγοντες, με αποτέλεσμα τα αντιβιοτικά φάρμακα να γίνουν λιγότερο αποτελεσματικά. Αυτό θα μπορούσε να καταστήσει πιο δύσκολη τη θεραπεία σοβαρών ιατρικών καταστάσεων που προκαλούνται από βακτήρια, όπως οι λοιμώξεις από σταφυλόκοκκο και η πνευμονία. Για παράδειγμα, πολλοί μικροοργανισμοί είναι ήδη ανθεκτικοί στην τρικλοζάνη, πράγμα που σημαίνει ότι παρόλο που είναι ένας αποδεδειγμένος αντιβακτηριακός παράγοντας, μπορεί να μην είναι τόσο αποτελεσματικός όσο δηλώνουν ορισμένοι κατασκευαστές σαπουνιών επειδή πολλά στελέχη βακτηρίων έχουν ανοσία σε αυτό.