Το western blot είναι μια τεχνική εργαστηριακής ανάλυσης που χρησιμοποιείται για την απομόνωση πρωτεϊνών. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί στη διάγνωση ορισμένων ασθενειών, καθώς και στην έρευνα για διάφορες πρωτεΐνες και διαδικασίες. Είναι γνωστό ότι το western blot συνδέεται με τη διάγνωση της λοίμωξης HIV, αλλά μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για την αναζήτηση ιχνών σπογγώδους εγκεφαλίτιδας των βοοειδών (ΣΕΒ) και νόσου του Lyme. Τα δείγματα που αποστέλλονται για δοκιμή με πρωτόκολλο western blot μπορούν να επιστρέψουν αποτελέσματα σε λίγες ημέρες έως αρκετές εβδομάδες, ανάλογα με τη χωρητικότητα του εργαστηρίου και την επείγουσα ανάγκη.
Σε ένα western blot, το δείγμα, το οποίο μπορεί να είναι από αίμα ή ιστό, υποβάλλεται πρώτα σε ηλεκτροφόρηση, έτσι ώστε οι πρωτεΐνες να διαχωριστούν κατά μήκος. Μια λωρίδα της γέλης ηλεκτροφόρησης με απομονωμένες πρωτεΐνες του μήκους στόχου μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη μεταφορά των πρωτεϊνών σε ένα υπόστρωμα νιτροκυτταρίνης για το επόμενο στάδιο της δοκιμής. Κατά τη διάρκεια αυτού του σταδίου, ένα αντίσωμα εισάγεται στο δείγμα, με στόχο την επισήμανση των πρωτεϊνών με αντιγόνα στα οποία το αντίσωμα κλειδώνει.
Μόλις επισημανθούν οι πρωτεΐνες, μπορούν εύκολα να αναγνωριστούν. Στην περίπτωση δοκιμής για ασθένεια, η παρουσία μιας αντιδραστικής πρωτεΐνης υποδηλώνει ότι το δείγμα έχει βγει θετικό. Τα Western blots σπάνια επιστρέφουν ψευδώς θετικά, αν και μπορεί να συμβεί περιστασιακά, και μπορεί επίσης να επιστρέψουν ψευδώς αρνητικά, στα οποία ένα άτομο έχει πραγματικά μια ασθένεια, αλλά δεν εμφανίζεται στη δοκιμή western blot. Αυτό μπορεί να είναι ιδιαίτερα συχνό σε περιπτώσεις όπου ο παράγοντας που προκαλεί τη νόσο δεν έχει ακόμη αρχίσει να αναπαράγεται.
Οι ερευνητές μπορούν να χρησιμοποιήσουν τα αποτελέσματα για να αναγνωρίσουν συγκεκριμένες πρωτεΐνες τις οποίες παρακολουθούν και για διάφορους άλλους σκοπούς. Η κατανόηση του τρόπου λειτουργίας του πρωτοκόλλου western blot είναι μια σημαντική ικανότητα για ορισμένους ερευνητές και τεχνικούς εργαστηρίων, καθώς πρέπει να είναι σε θέση να επιστρέφουν αξιόπιστα και αξιόπιστα αποτελέσματα χρησιμοποιώντας αυτήν τη μέθοδο. Εργαστηριακές δεξιότητες, συμπεριλαμβανομένης της εκμάθησης πώς να χειρίζεστε περίπλοκα ή κακά δείγματα και πώς να αποφεύγετε τη μόλυνση κατά τη διάρκεια της διαδικασίας, ώστε τα αποτελέσματα της δοκιμής να είναι γνωστό ότι είναι αληθινά.
Αυτή η τεχνική είναι μερικές φορές γνωστή ως ανοσοκηλίδα, επειδή ουσιαστικά οι επιθυμητές πρωτεΐνες «στυπώνονται» με αντισώματα έτσι ώστε να εμφανιστούν. Αυτή η δοκιμή μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την αναζήτηση πρωτεϊνών σε όλα τα ζώα, όχι μόνο στους ανθρώπους, με τους κτηνιάτρους να χρησιμοποιούν συχνά το τεστ western blot για να προσδιορίσουν εάν ένα κοπάδι αγελάδων έχει μολυνθεί ή εκτεθεί στη ΣΕΒ.