Πιθανώς η πιο κοινή αιτία πόνου στα νεφρά είναι μια λοίμωξη των νεφρών, γνωστή ως πυελονεφρίτιδα, όπου ο θαμπός, πονεμένος πόνος στο άνω μέρος της πλάτης εμφανίζεται στη μία πλευρά, γύρω από το επίπεδο των χαμηλότερων πλευρών, μαζί με συμπτώματα όπως πυρετός και αίμα στα ούρα. Οι πέτρες στα νεφρά μπορεί να προκαλέσουν έντονο και ξαφνικό πόνο, ωστόσο, καθώς αυτό συμβαίνει όταν η πέτρα έχει φύγει από το νεφρό και κινείται κατά μήκος του σωλήνα ή του ουρητήρα, που οδηγεί στην ουροδόχο κύστη, θα μπορούσε να υποστηριχθεί ότι δεν πρόκειται τεχνικά για πόνο στα νεφρά. Είναι σημαντικό να θυμάστε ότι ορισμένες παθήσεις που είναι αρκετά σοβαρές ώστε να προκαλέσουν νεφρική ανεπάρκεια δεν οδηγούν σε πόνο και ότι ο πόνος μπορεί να φαίνεται ότι προέρχεται από τα νεφρά, αλλά άλλες ασθένειες μπορεί να προκαλούν τον πόνο στην ίδια περιοχή. Μερικές φορές οι άνθρωποι υποθέτουν ότι ο πόνος στο κάτω μέρος της πλάτης είναι πόνος στα νεφρά, αλλά οι νεφροί βρίσκονται ελαφρώς ψηλότερα, σφιγμένοι μέσα στις κάτω πλευρές στο πίσω μέρος του κορμού. Άλλες πιθανές αιτίες πόνου στα νεφρά περιλαμβάνουν θρόμβους αίματος, όγκους, λοίμωξη του ουροποιητικού συστήματος και οποιαδήποτε νεφρική νόσο που οδηγεί σε θάνατο του νεφρικού ιστού.
Η κατάσταση γνωστή ως αθηροσκλήρωση, όπου οι αρτηρίες στενεύουν, μπορεί να οδηγήσει στο σχηματισμό θρόμβου αίματος στη νεφρική αρτηρία που τροφοδοτεί το νεφρό. Η απώλεια της παροχής αίματος σε κάποιο ή όλο τον ιστό των νεφρών προκαλεί ξαφνικό πόνο και πιθανώς αίμα στα ούρα. Οι όγκοι των νεφρών μπορούν επίσης να προκαλέσουν αίμα στα ούρα, αλλά ο πόνος που εμφανίζεται λόγω των όγκων τείνει να αναπτύσσεται πιο σταδιακά. Η υδρονέφρωση είναι μια άλλη κατάσταση που μπορεί να προκαλέσει πόνο στα νεφρά. Στην υδρονέφρωση, μια απόφραξη της ροής των ούρων από το νεφρό από έναν όγκο, πέτρα ή συστροφή στο ουροποιητικό σύστημα οδηγεί σε αντίθλιψη των ούρων και ένα πρησμένο νεφρό.
Η διάγνωση του πόνου στα νεφρά μπορεί να πραγματοποιηθεί χρησιμοποιώντας τεστ όπως ράβδοι μέτρησης ούρων και καλλιέργειες ούρων. Οι ράβδοι μέτρησης ούρων αλλάζουν χρώμα για να υποδείξουν ανωμαλίες στα ούρα, όπως αλλαγές στην οξύτητα και τη συγκέντρωση ή την παρουσία αίματος, πρωτεΐνης, βακτηρίων και άλλων ουσιών. Μια λοίμωξη των νεφρών θα μπορούσε να οδηγήσει σε ανεύρεση αίματος και πρωτεΐνης στα ούρα και μια καλλιέργεια ούρων, όπου τα μικρόβια από ένα δείγμα ούρων επιτρέπεται να αναπτυχθούν, θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για τον προσδιορισμό του τύπου των βακτηρίων που εμπλέκονται.
Οι ακτινογραφίες και οι σαρώσεις των νεφρών και του ουροποιητικού συστήματος μπορούν να βοηθήσουν στη διάγνωση της αιτίας του πόνου στα νεφρά. Ένα δείγμα νεφρικού ιστού, γνωστό ως βιοψία, μπορεί να ληφθεί για να αναζητηθούν σημεία ασθένειας. Ορισμένες διαταραχές των νεφρών, όπως η πολυκυστική νεφρική νόσος, προκαλούν υψηλή αρτηριακή πίεση καθώς και πόνο και η αρτηριακή πίεση μπορεί να μετρηθεί κατά τη διάρκεια των ερευνών. Μπορεί να γίνουν εξετάσεις αίματος για να ελεγχθεί εάν συσσωρεύονται απόβλητα στο αίμα λόγω απώλειας της νεφρικής λειτουργίας. Η θεραπεία του πόνου στα νεφρά ποικίλλει ανάλογα με την αιτία, αλλά τις περισσότερες φορές ο πόνος υποχωρεί όταν η υποκείμενη πάθηση αντιμετωπιστεί επιτυχώς.