Υπάρχουν πολλές διαφορετικές αιτίες του πόνου του οισοφαγικού σφιγκτήρα. Ένα από τα πιο κοινά είναι η γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση. Άλλες αιτίες περιλαμβάνουν διάχυτους οισοφαγικούς σπασμούς, οισοφάγο καρυοθραύστη και υπερευαίσθητο οισοφάγο. Πολλές περιπτώσεις πόνου στον οισοφάγο παρουσιάζουν παρόμοια συμπτώματα με την καρδιακή ανεπάρκεια, επομένως η σωστή διάγνωση από γιατρό είναι απαραίτητη για να αποκλειστεί η καρδιακή νόσος.
Μία από τις πιο κοινές αιτίες πόνου στον οισοφαγικό σφιγκτήρα είναι η γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση, που ονομάζεται επίσης ΓΟΠΝ. Ο κατώτερος οισοφαγικός σφιγκτήρας παραμένει κανονικά κλειστός, εκτός εάν αφήνουμε την τροφή να περάσει στο στομάχι, προκειμένου να αποτραπεί η έκχυση του στομαχικού οξέος και της τροφής πίσω στον οισοφάγο. Εάν ο σφιγκτήρας είναι εξασθενημένος από υπερκατανάλωση τροφής, διαφραγματοκήλη ή οποιονδήποτε άλλο λόγο, το επιβλαβές οξύ του στομάχου μπορεί να εισέλθει στον οισοφάγο, προκαλώντας πόνο.
Ο πόνος στον οισοφαγικό σφιγκτήρα προκαλείται μερικές φορές από σπασμούς του οισοφάγου. Υπάρχουν δύο διαφορετικοί τύποι οισοφαγικών σπασμών, συμπεριλαμβανομένων των διάχυτων οισοφαγικών σπασμών και του οισοφάγου καρυοθραύστη. Ο οισοφάγος συστέλλεται όταν είναι υγιής και χρησιμεύει για τη μετακίνηση της τροφής από το λαιμό προς το στομάχι για πέψη. Περιστασιακά υπάρχουν δυσλειτουργίες σε αυτό το σύστημα που μπορεί να προκαλέσουν πόνο στον οισοφάγο.
Οι διάχυτοι σπασμοί του οισοφάγου συμβαίνουν όταν οι φυσιολογικές συσπάσεις που σπρώχνουν προς τα κάτω τα τρόφιμα δεν λειτουργούν σωστά. Αυτή η διαταραχή εμφανίζεται συχνότερα καθώς συστέλλονται πολλά τμήματα του οισοφάγου ταυτόχρονα. Όταν ο οισοφάγος συστέλλεται ακατάλληλα, η τροφή μπορεί να κολλήσει στη θέση της, να μην μπορεί να κινηθεί στο στομάχι, προκαλώντας πόνο. Η ακριβής αιτία αυτής της διαταραχής είναι άγνωστη, αλλά εμφανίζεται πιο συχνά σε ενήλικες γυναίκες του Καυκάσου. Ορισμένες θεωρίες σχετικά με την αιτία αυτής της δυσλειτουργίας περιλαμβάνουν γαστρική παλινδρόμηση, πρωτοπαθή διαταραχή του νεύρου ή κινητήρα ή συμπίεση των αιμοφόρων αγγείων στο πνευμονογαστρικό νεύρο.
Ένας οισοφάγος καρυοθραύστη είναι μια άλλη αιτία πόνου του οισοφαγικού σφιγκτήρα που μοιάζει πολύ με τους διάχυτους οισοφαγικούς σπασμούς. Αυτή η διαταραχή εμφανίζεται όταν οι συσπάσεις στον οισοφάγο έχουν την κατάλληλη σειρά για να σπρώξουν προς τα κάτω την τροφή, αλλά η ένταση των συσπάσεων είναι περισσότερο από δύο φορές ισχυρότερη από τις κανονικές συσπάσεις. Η αιτία αυτής της διαταραχής, όπως οι διάχυτοι σπασμοί του οισοφάγου, είναι άγνωστη.
Η υπερευαισθησία του οισοφάγου είναι μια άλλη πιθανή αιτία του πόνου του οισοφαγικού σφιγκτήρα. Η υπερευαισθησία του οισοφάγου εμφανίζεται όταν οι φυσιολογικές διεργασίες στον οισοφάγο προκαλούν μη φυσιολογικές αισθήσεις πόνου. Προκαλείται από μια δυσλειτουργία στους υποδοχείς του πόνου, με αποτέλεσμα τη μείωση του ουδού πόνου. Ο οισοφάγος περιέχει χημειοϋποδοχικά νεύρα, νεύρα μηχανοϋποδοχέων και νεύρα θερμοϋποδοχέων, τα οποία μπορεί να υπερδιεγερθούν, προκαλώντας πόνο.