Οι θρόμβοι αίματος της εμμήνου ρύσεως μπορεί να προκληθούν από ανισορροπία στους παράγοντες πήξης και αντιπηκτικών στο αίμα ή από ορμονικές αλλαγές. Τα ινομυώματα και η ενδομητρίωση συμβάλλουν στην υπερβολική συσσώρευση της επένδυσης της μήτρας, η οποία απελευθερώνεται ως θρόμβοι. Η αποβολή μπορεί επίσης να παρατηρηθεί σε μορφή θρόμβου. Η έντονη έμμηνος ρύση θα πρέπει να αξιολογηθεί από γιατρό για να διασφαλιστεί ότι δεν υπάρχουν σοβαρά προβλήματα.
Όταν η ωορρηξία δεν οδηγεί σε εγκυμοσύνη, η μήτρα αποβάλλει την επένδυση που έχει δημιουργήσει για την εμφύτευση. Αυτή η διαδικασία είναι η έμμηνος ρύση, που συνήθως ονομάζεται περίοδος. Το αίμα και ο ιστός αποβάλλονται μέσω του κόλπου. Σε γυναίκες των οποίων η περίοδος είναι βαριά, μπορεί να παρατηρηθούν θρόμβοι αίματος. Αν και ανησυχητικό, συνήθως δεν προκαλεί ανησυχία.
Η επένδυση της μήτρας εκκρίνει έναν παράγοντα κατά της πήξης κατά τη διάρκεια της περιόδου για να βοηθήσει τη ροή του αίματος. Εάν η ουσία δεν επαρκεί για να ξεπεραστεί ο φυσικός παράγοντας πήξης μπορεί να σχηματιστούν θρόμβοι αίματος της περιόδου, μια διαδικασία γνωστή ως αιμόσταση. Η ροή μπορεί να επιβραδυνθεί προς το τέλος μιας περιόδου και το αίμα μπορεί να συσσωρευτεί. Όταν οι γυναίκες ξαπλώνουν για κάποιο χρονικό διάστημα, όπως όταν κοιμούνται, οι εκκρίσεις θα λιμνάζουν και οι θρόμβοι αίματος θα απομακρύνονται όταν στέκονται. Το αίμα σκουραίνει καθώς κάθεται και μερικές φορές φαίνεται καφέ ή μαύρο.
Το ινομύωμα είναι ένας καλοήθης όγκος που αναπτύσσεται στη μήτρα. Μπορεί να προκαλέσει αύξηση της εμμηνορροϊκής ροής και θρόμβους αίματος της περιόδου. Τα ινομυώματα συνήθως δεν έχουν συμπτώματα, αλλά τα μεγάλα προκαλούν μερικές φορές πόνο και έντονη αιμορραγία. Μπορούν να αφαιρεθούν χειρουργικά ή να συρρικνωθούν με φαρμακευτική αγωγή. Τις περισσότερες φορές δεν παρεμποδίζουν την εγκυμοσύνη.
Η ενδομητρίωση είναι μια κατάσταση κατά την οποία η επένδυση της μήτρας, ή το ενδομήτριο, αναπτύσσεται έξω από αυτήν, στις σάλπιγγες ή στην κοιλιά. Ο ιστός αιμορραγεί και χύνεται όπως συνήθως, αλλά επειδή δεν υπάρχει έξοδος για αυτόν, μπορεί να εμφανιστούν ουλές και πόνος. Η έντονη αιμορραγία με θρόμβους ή μεταξύ περιόδου είναι ένα σύμπτωμα. Η κατάσταση αντιμετωπίζεται με φάρμακα και χειρουργική επέμβαση. Σε σοβαρές περιπτώσεις, η ολική υστερεκτομή μαζί με την αφαίρεση των ωοθηκών μπορεί να είναι η μόνη λύση.
Μια γυναίκα που είναι έγκυος ή μπορεί να είναι έγκυος και έχει μεγάλους θρόμβους αίματος της εμμήνου ρύσεως μπορεί να έχει αποβολή. Συνήθως υπάρχει πόνος επειδή η μήτρα συσπάται για να αποβάλει το υλικό. Ο πλακούντας, η επένδυση και άλλοι ιστοί μπορεί να εμφανίζονται ως μεγάλοι θρόμβοι αίματος ή συστάδες ύλης. Η αποβολή συνήθως συμβαίνει επειδή κάτι έχει πάει στραβά με την εγκυμοσύνη και δεν είναι πλέον βιώσιμη. Οι γυναίκες μεγαλύτερης ηλικίας και όσες είχαν πολύδυμη κύηση είναι πιο επιρρεπείς σε αποβολές.
Οι ορμονικές αλλαγές μπορεί επίσης να δημιουργήσουν θρόμβους. Εάν μια γυναίκα έχει πολύ έντονη ροή και επίμονους θρόμβους σε τακτική βάση, θα πρέπει να συμβουλευτεί το γιατρό της. Τα αντισυλληπτικά χάπια αλλάζουν την ορμονική ισορροπία και μπορεί να κάνουν την περίοδο πιο ελαφριά και πιο ανεκτή.