Ένας ηλιακός θερμοσίφωνας θερμοκηπίου έχει πολλά πλεονεκτήματα, καθώς και μερικά μειονεκτήματα. Οποιαδήποτε απαραίτητη θερμότητα παρέχεται από τον ήλιο, ο οποίος είναι ένας καθαρός, ανανεώσιμος πόρος. Ένα άτομο με ηλιακό θερμοσίφωνο θερμοκηπίου θα έχει συνήθως πολύ χαμηλότερους λογαριασμούς ενέργειας από κάποιον που έχει ένα θερμοκήπιο που θερμαίνεται από άλλους τύπους θερμαντήρων θερμοκηπίου. Από την άλλη πλευρά, μπορεί να μην υπάρχει επαρκής ζέστη τις συννεφιασμένες μέρες. Επίσης, ορισμένος εξοπλισμός ηλιακού θερμοκηπίου μπορεί να είναι ακριβός και μπορεί να είναι δύσκολο να διατηρηθεί το εσωτερικό ενός ηλιακού θερμοκηπίου σε σταθερή θερμοκρασία χρησιμοποιώντας αυτόν τον τύπο θερμαντήρα.
Ένα από τα μεγαλύτερα πλεονεκτήματα ενός ηλιακού θερμοσίφωνα θερμοκηπίου είναι ότι ο ήλιος είναι ένας πλήρως ανανεώσιμος πόρος. Ορισμένοι θερμαντήρες θερμοκηπίου τροφοδοτούνται από φυσικό αέριο, το οποίο είναι ένας μη ανανεώσιμος πόρος. Ένας ηλιακός θερμοσίφωνας θερμοκηπίου είναι επίσης πολύ καλύτερος για το περιβάλλον επειδή η ενέργεια που χρησιμοποιείται από αυτούς τους θερμαντήρες είναι καθαρή. Δεν προκύπτουν επικίνδυνα υποπροϊόντα ή χημικά από τη χρήση των ακτίνων του ήλιου για τη θέρμανση ενός θερμοκηπίου. Ορισμένα ορυκτά καύσιμα, από την άλλη πλευρά, συχνά καταλήγουν σε επικίνδυνα υποπροϊόντα, όπως καρκινογόνα.
Θερμοκήπια που θερμαίνονται με φυσικό αέριο ή ηλεκτρικό μπορεί να είναι δαπανηρή η συντήρηση. Με έναν ηλιακό θερμοσίφωνα θερμοκηπίου, από την άλλη πλευρά, ένα άτομο συνήθως δεν χρειάζεται να ανησυχεί για υψηλό λογαριασμό αερίου ή ηλεκτρικού ρεύματος. Ο ήλιος είναι ένας δωρεάν πόρος και κανείς δεν χρεώνεται να τον χρησιμοποιήσει.
Ωστόσο, μπορεί να χρειαστεί ένας θερμαντήρας αερίου ή ηλεκτρικής ενέργειας για να συμπληρώσει έναν ηλιακό θερμοσίφωνα θερμοκηπίου ως εφεδρικό. Ένα από τα μεγαλύτερα μειονεκτήματα της ηλιακής ενέργειας είναι ότι δεν είναι πάντα απόλυτα αξιόπιστη. Τις συννεφιασμένες μέρες των πιο κρύων μηνών, για παράδειγμα, ο ήλιος μπορεί να μην παρέχει αρκετή θερμότητα για να διατηρήσει τα φυτά υγιή.
Η κατασκευή ενός ηλιακού θερμαντήρα θερμοκηπίου μπορεί επίσης να κοστίσει λίγο περισσότερο από την αγορά ενός παραδοσιακού συστήματος λαμπτήρων θερμότητας. Οι ηλιακές προμήθειες θερμοκηπίου μπορεί να είναι μάλλον ακριβές. Εάν ένα άτομο σκοπεύει να χρησιμοποιήσει ηλιακούς συλλέκτες, αυτό θα επηρεάσει επίσης το κόστος κατασκευής ενός ηλιακού θερμοκηπίου, καθώς αυτά είναι συνήθως ακριβά.
Η ρύθμιση της θερμοκρασίας μέσα σε ένα θερμοκήπιο με ηλιακό θερμοσίφωνα μπορεί μερικές φορές να είναι δύσκολη. Κατά τους ζεστούς μήνες, το εσωτερικό αυτών των θερμοκηπίων μπορεί να ζεσταθεί πολύ. Αυτό μπορεί συνήθως να διορθωθεί, ωστόσο, ανοίγοντας μια πόρτα ή ένα παράθυρο.