Ένα αερόβιο σηπτικό σύστημα είναι ένα σηπτικό σύστημα στο οποίο τα βακτήρια ενθαρρύνονται να αναπτυχθούν με σκοπό την περαιτέρω διάσπαση των εκροών από το σηπτικό σύστημα πριν απελευθερωθούν. Αυτά τα σηπτικά συστήματα απαιτούν λιγότερο χώρο και μπορούν να χρησιμοποιηθούν όταν ένα συμβατικό αναερόβιο σηπτικό δεν ταιριάζει ή δεν είναι πρακτικό. Μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για την εκ των υστέρων τοποθέτηση ή επισκευή ενός συμβατικού σηπτικού συστήματος που έχει αρχίσει να δυσλειτουργεί. Πολλές εταιρείες κατασκευάζουν αερόβια σηπτικά συστήματα και μπορούν να εγκατασταθούν από επαγγελματίες υδραυλικούς και σηπτικούς.
Η αρχική επεξεργασία σε ένα αερόβιο σηπτικό σύστημα είναι παρόμοια με εκείνη ενός συμβατικού συστήματος, με τα λύματα να ρέουν σε μια δεξαμενή που επιτρέπει στα στερεά να καθιζάνουν στον πυθμένα ενώ το υγρό ρέει σε μια δευτερεύουσα δεξαμενή. Σε αυτή τη δεξαμενή, οι φυσητήρες κρατούν τον αέρα να κινείται έτσι ώστε τα αερόβια βακτήρια να μπορούν να ευδοκιμήσουν και επεξεργάζονται τα λύματα, τα οποία ρέουν έξω μέσω ενός άλλου σωλήνα. Σε ορισμένες περιοχές, τα λύματα πρέπει να αποστειρωθούν με μια χημική ουσία όπως η χλωρίνη πριν απελευθερωθούν, για να σκοτωθούν οι μικροοργανισμοί στα απόβλητα.
Απαιτείται λιγότερος χώρος με ένα αερόβιο σηπτικό σύστημα, επειδή το σύστημα επεξεργάζεται τα λύματα πολύ γρήγορα, χάρη στους μικροοργανισμούς που κάνουν τη δουλειά. Ωστόσο, η λειτουργία και η συντήρηση του συστήματος μπορεί να είναι ακριβή. Απαιτείται ηλεκτρική ενέργεια για τη λειτουργία των ανεμιστών αέρα και του αναδευτήρα στη δεξαμενή και πρέπει να ληφθεί μέριμνα ώστε να διασφαλιστεί ότι η ισορροπία των μικροοργανισμών στη δεξαμενή είναι υγιής, πράγμα που σημαίνει ότι οι άνθρωποι πρέπει να είναι προσεκτικοί σχετικά με το τι εναποθέτουν στο σηπτικό σύστημα. εάν χρησιμοποιούν χλωρίνη στις τουαλέτες τους τακτικά, για παράδειγμα, μπορεί να διαταράξει τα βακτήρια.
Σε ορισμένες περιοχές, οι άνθρωποι επιτρέπεται να εγκαταστήσουν ένα αερόβιο σηπτικό σύστημα μόνο εάν είναι πρόθυμοι να δεσμευτούν σε συμβόλαιο συντήρησης με πιστοποιημένη εταιρεία. Αυτή η απαίτηση είναι αποτέλεσμα ανησυχιών για τη δημόσια ασφάλεια, διότι εάν το αερόβιο σηπτικό σύστημα δεν συντηρηθεί σωστά, μπορεί να οδηγήσει σε εξάπλωση ασθενειών από μη επεξεργασμένα λύματα. Οι εταιρείες που εγκαθιστούν τέτοια συστήματα έχουν συχνά τα προσόντα για την εκτέλεση συντήρησης και μπορούν να συνάψουν σύμβαση συντήρησης κατά τη στιγμή της εγκατάστασης.
Αυτά τα συστήματα έχουν σχεδιαστεί κυρίως για χρήση μικρής κλίμακας, λειτουργώντας σαν μια μικροσκοπική μονάδα επεξεργασίας νερού για μια κατοικία και χρησιμοποιούνται κυρίως σε αγροτικές περιοχές. Τα αποστειρωμένα λύματα που προκύπτουν μπορούν να χρησιμοποιηθούν για καλλωπιστική κηπουρική ή εξωραϊσμό και δεν πρέπει να εφαρμόζονται σε καλλιέργειες τροφίμων, μόνο σε περίπτωση που οποιοσδήποτε μικροοργανισμός έχει καταφέρει να το κάνει μέχρι το τέλος του συστήματος.