Το μαγγάνιο χρησιμοποιείται σε πολλές βιομηχανικές μεταλλουργικές διεργασίες. Έχει ιδιαίτερη σημασία στη δημιουργία κραμάτων χάλυβα και αλουμινίου, αλλά οι χρήσεις του μαγγανίου επεκτείνονται και σε άλλες βιομηχανικές περιοχές εκτός της μεταλλουργίας. Το μαγγάνιο είναι επίσης σημαντικό στη διατροφή. Το ανθρώπινο σώμα δεν απαιτεί μεγάλο μέρος αυτού του στοιχείου, αλλά πολλές βιολογικές χρήσεις του μαγγανίου είναι κρίσιμες για την καλή λειτουργία του σώματος και συχνά περιλαμβάνεται σε μικρές δόσεις σε συμπληρώματα μετάλλων.
Η πιο σημαντική από όλες τις βιομηχανικές χρήσεις του μαγγανίου είναι η παραγωγή χάλυβα που χρησιμοποιεί περισσότερο από το 85% του συνόλου του μαγγανίου που εξορύσσεται. Το μαγγάνιο μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε πολλές διαφορετικές διεργασίες κράματος για τη βελτίωση της ανθεκτικότητας του χάλυβα. Το μετάλλευμα είναι ιδιαίτερα χρήσιμο για την αύξηση της αντοχής του χάλυβα στην οξείδωση, επομένως το μαγγάνιο χρησιμοποιείται συχνά για την κατασκευή ανοξείδωτου χάλυβα. Η προσθήκη μαγγανίου στο χάλυβα μπορεί επίσης να βελτιώσει τη συνολική αντοχή και εργασιμότητα του υλικού. Το Hadfield Steel είναι ένα παράδειγμα μείγματος χάλυβα και μαγγανίου και είναι γνωστό και για τις δύο αυτές ιδιότητες.
Άλλα μέταλλα μπορούν επίσης να κραματωθούν με μαγγάνιο. Τα κράματα αλουμινίου και μαγγανίου είναι αρκετά κοινά. Το μαγγάνιο ενισχύει την αντοχή του αλουμινίου στη διάβρωση και χρησιμοποιούνται συνήθως κράματα που περιέχουν περίπου 1% μαγγάνιο. Τα δοχεία αλουμινίου που είναι γνωστά στους περισσότερους καταναλωτές ποτών παράγονται με ακριβώς ένα τέτοιο κράμα.
Η βιομηχανική χημεία χρησιμοποιεί και μαγγάνιο. Οι συνήθεις χρήσεις του μαγγανίου σε αυτόν τον τομέα περιστρέφονται γύρω από τη χρησιμότητά του ως χρωστική ουσία. Οι χρωστικές με γήινες αποχρώσεις συχνά περιέχουν μαγγάνιο. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την παραγωγή παρόμοιων αποχρώσεων όταν προστίθεται σε τούβλα.
Οι αλκαλικές μπαταρίες μιας χρήσης χρησιμοποιούν συχνά μαγγάνιο. Το μαγγάνιο είναι η κάθοδος σε αυτές τις μπαταρίες. Άλλα ορυκτά μπορούν να χρησιμοποιηθούν για το σκοπό αυτό, αλλά το κόστος και οι χημικές ιδιότητες του μαγγανίου το καθιστούν μια πολύ κοινή επιλογή.
Υπάρχει μια σειρά από βιολογικές και βιοχημικές χρήσεις του μαγγανίου. Η συντριπτική πλειονότητα των οργανισμών χρησιμοποιεί μαγγάνιο μόνο σε ίχνη σε βιολογικές διεργασίες. Το ανθρώπινο σώμα δεν αποτελεί εξαίρεση σε αυτόν τον κανόνα.
Το μαγγάνιο φαίνεται να είναι ιδιαίτερα σημαντικό για την καλή λειτουργία των ενζύμων. Αυτά τα ένζυμα έχουν μια ποικιλία διαφορετικών λειτουργιών. Κάποια βοήθεια στην αποκατάσταση βλαβών στο σώμα. Άλλα είναι αντιοξειδωτικά. Πρόσθετα ένζυμα χρησιμοποιούν μαγγάνιο για να βοηθήσουν στην ανάπτυξη δυνατών και υγιών οστών.
Δεδομένου του αριθμού των χρήσεων του μαγγανίου στο ανθρώπινο σώμα, συχνά περιλαμβάνεται στα συμπληρώματα μετάλλων. Μικρές συμπληρωματικές δόσεις μαγγανίου είναι είτε ωφέλιμες είτε αβλαβείς. Το σώμα δεν είναι εξοπλισμένο να επεξεργάζεται μεγάλες ποσότητες αυτού του ορυκτού, ωστόσο, και σε μεγαλύτερες δόσεις το μαγγάνιο μπορεί να είναι τοξικό.