Ideea unei pietre filosofale este una comună în mitologia europeană. JK Rowling a împrumutat ideea unei pietre create alchimic cu proprietăți magice pentru populara sa serie Harry Potter. În cărțile Harry Potter, există o singură piatră filosofală, creată de Nicolas Flamel în anii 1400. Piatra lui Flamel este capabilă să transforme obiectele în aur și să producă un Elixir al vieții care îi conferă băutorului nemurirea.
Elementul magic a apărut pentru prima dată în Harry Potter și Piatra Filosofală, care a fost lansat sub titlul Harry Potter și Piatra Vrăjitorului în Statele Unite. Scholastic, editorul american al cărților Harry Potter, credea că cititorii americani nu ar fi la fel de atrași de o carte despre „Piatra filosofală”. Această alegere a fost criticată, odată cu americanizarea cărților Harry Potter lansate în Statele Unite: s-au făcut mici modificări în limbajul pe care personajele o foloseau din teama că americanii nu l-ar înțelege.
Piatra filosofală este un element crucial al cărții. Nicolas Flamel este un prieten cu Albus Dumbledore, director al Școlii de Vrăjitorie și Vrăjitorie Hogwarts. Cei doi au lucrat împreună la proiecte de alchimie, probabil lucrând cu Piatra Filosofală însăși pentru a-i explora proprietățile. Flamel se întoarce și la Dumbledore pentru a păstra piatra în siguranță, iar în prima parte a cărții, aceasta este mutată de la Seiful 713 de la Gringotts la Hogwarts, unde se presupune că este mai sigură.
Cooperând cu mai mulți instructori de la școală, Dumbledore pune o serie de obstacole în calea Pietrei Filosofale pentru a o proteja. Seria de protecție fermecată este concepută pentru a-l împiedica pe Voldemort să obțină Piatra Filosofală, deoarece Dumbledore este îngrijorat că Voldemort se va ridica din nou. În cele din urmă, Voldemort este capabil să pătrundă toate protecțiile, cu excepția ultimei: Dumbledore ascunde inteligent piatra din Oglinda lui Erised, în așa fel încât doar cineva care vrea să găsească Piatra Filosofală, dar nu o folosește, o poate obține.
Într-o lecție despre scopuri și motive, Harry o primește pentru că se uită în oglindă fără intenție de a o folosi și, de asemenea, rezistă cu succes unei încercări a lui Voldemort de a lua Piatra Filosofală cu forța. După această scenă culminală, Piatra Filosofală este distrusă pentru a-l împiedica pe Voldemort să o obțină, iar Nicolas Flamel și soția sa se pregătesc pentru moartea lor. Harry este inițial îngrijorat de cei doi, dar Dumbledore subliniază că Flamel trăiește de peste șase sute de ani și probabil că este gata să urmeze „următoarea mare aventură” a morții.