Miceliul este porțiunea vegetativă a unei ciuperci, ceea ce înseamnă că este porțiunea care se propagă prin reproducere asexuată. Constă dintr-o rețea de hife, structuri sub formă de fire ramificate sau bifurcate. În funcție de tipul de ciupercă și de cât de bine dezvoltată este, miceliul poate fi vizibil sau microscopic. Mucegaiul care crește pe alimentele în descompunere, de exemplu, este o formă vizibilă.
Pe lângă reproducerea asexuată, miceliul este responsabil pentru absorbția nutrienților din mediu. Eliberează enzime în mediul înconjurător pentru a descompune sursa de hrană într-o formă digerabilă, apoi o absoarbe. Acest proces ajută, de asemenea, materialul vegetal mort și alte materiale organice să se descompună. Materialul poate ajuta, de asemenea, la reînnoirea solului prin acest proces, de exemplu prin descompunerea contaminanților precum pesticidele. Unele micelii ajută plantele să absoarbă mai eficient apa și nutrienții, iar altele sunt, de asemenea, surse importante de hrană pentru nevertebratele care trăiesc în sol.
Micelia poate fi, de asemenea, extrem de extinsă. O colonie de ciuperci notorie din pădurea din estul Oregonului acoperea odată 2,400 de acri (9.7 km pătrați). A crescut la o asemenea dimensiune în aproximativ 2,200 de ani și a ucis creșterea plantelor din pădure de multe ori, de fiecare dată ducând la straturi mai adânci de sol care ar putea rezista la creșterea copacilor din ce în ce mai mari.
Uneori, miceliul este folosit în agricultură sau amenajare a teritoriului. Pe lângă capacitatea sa de a reumple nutrienții, unele tipuri de ciuperci formează o relație simbiotică, numită micoriză, cu rădăcinile unei plante. Planta și ciuperca se ajută reciproc să primească nutrienți pe care nu i-au putut obține singuri. Micelia poate fi folosită și ca filtru organic pentru sol sau apă într-un proces numit micofiltrare, în care un covor miceliar ține departe substanțele chimice și microorganismele dăunătoare. De asemenea, uneori sunt folosite pentru a menține pământul nou pe drumurile neasfaltate.
Unele tipuri de ciuperci folosesc reproducerea sexuală, precum și reproducerea asexuată. Porțiunea care se reproduce sexual a unei ciuperci provine din miceliu și se numește sporocarp sau corp fructifer. Corpurile fructifere ale multor tipuri diferite de ciuperci sunt cunoscute sub numele de ciuperci sau trufe, deși există și alte tipuri.