Care sunt diferitele tipuri de kituri de izolare ARN?

Majoritatea truselor de izolare a acidului ribonucleic (ARN) pot izola ARN de înaltă calitate dintr-o gamă largă de țesuturi și tipuri de organisme, inclusiv plante, animale și viruși. ARN-ul mitocondrial și ribozomal – ARNm și, respectiv, ARNr – pot necesita truse specializate de izolare a ARN-ului specifice pentru catenele mici de ARN. Alți factori care pot diferi între diferitele kituri de izolare sunt cantitatea de probe pe care fiecare kit le poate procesa și timpul necesar procesării complete a unei probe.

Cele mai comune tipuri de truse de izolare ARN pot fi utilizate pentru o mare varietate de aplicații, indiferent de unde provine ARN-ul. Celulele și țesuturile de mamifere sunt printre cele mai predominante surse utilizate pentru izolarea și purificarea ARN. Celulele vegetale și virușii sunt, de asemenea, utilizați în experimentele de biologie moleculară care necesită utilizarea unui kit de izolare a ARN.

Odată ce proba de țesut sau de sânge este colectată, aceasta trebuie pregătită pentru izolarea ARN-ului în timpul unui proces critic cunoscut sub numele de degradare celulară, separare sau perturbare. Dacă materialul celular nu este complet perturbat, procesul de izolare a ARN va produce mai puțin ARN. Cele mai bune truse de izolare a ARN includ materiale și consumabile pentru degradarea celulară înainte de izolare și purificarea ARN după izolare.

În cazuri speciale în care un experiment necesită ARNm sau ARNr, kituri specializate de izolare a ARN sunt disponibile pentru catenele de ARN care sunt deosebit de mici. Materialele și consumabilele incluse într-un astfel de kit pot fi diferite în ceea ce privește cantitatea și dimensiunea. Aceste truse de izolare ARN sunt mai puțin comune decât kiturile ARN multifuncționale și poate exista o diferență substanțială de cost.

Multe truse obișnuite de izolare a ARN-ului sunt concepute pentru a fi utilizate cu toate tipurile de țesuturi și celule și pot finaliza o reacție în aproximativ 20 de minute. Timpul necesar pentru degradarea celulară completă poate varia în funcție de locul în care au fost colectate celulele din organism. Dincolo de etapa de degradare celulară, procesul de izolare a ARN și purificarea ulterioară sunt relativ standard în ceea ce privește procedura și timp.

O altă caracteristică care poate fi specifică anumitor truse este cantitatea de probă necesară procesării reacției. În timp ce unele kituri de izolare pot necesita un volum de probă relativ mare, alte kituri pot funcționa bine cu un volum mai mic. Această diferență poate fi un avantaj dacă volumul probei este un factor limitator.
Mai mulți producători de truse de izolare ARN au diagrame de comparație disponibile pe Internet. Aceste diagrame pot fi folosite pentru a vedea diferențele dintre diferitele kituri pe care le produc. Diferențele pot include tipuri de aplicații specializate, substanțe chimice și volume de probe necesare.