Ce este adnotarea genomului?

Adnotarea genomului etichetează secțiuni ale unui genom cu informații despre datele genetice pe care le conține. Acest lucru face parte din procesul de la proiectele genomului, în care scopul nu este doar de a secvența ADN-ul unui organism țintă, ci de a înțelege ce face și cum funcționează. Cercetătorii pot efectua adnotări în laboratoarele lor și pot partaja date cu alți oameni de știință pentru a pune în comun resurse și informații. Sunt disponibile baze de date online deschise publicului, iar unele permit, de asemenea, membrilor publicului larg să trimită propriile adnotări.

Primul pas în adnotarea genomului este secvențierea, în care cercetătorii determină ordinea aminoacizilor din ADN-ul unui organism. Secvențierea unui întreg genom durează mult timp și este obișnuit ca oamenii de știință să înceapă adnotarea înainte ca genomul să fie decodat. Cu o secțiune de ADN secvențial în mână, un cercetător poate începe să adnoteze. Oamenii de știință pot observa unde par să înceapă și să se oprească genele, acordând atenție șirurilor distincte de ADN care conțin informații despre funcția genomului.

Calculatoarele sunt capabile să efectueze anumite adnotări ale genomului pe cont propriu. Ei pot căuta modele cunoscute, cum ar fi șiruri de aminoacizi care apar la începutul și la sfârșitul genelor. În adnotarea automată, computerul poate adăuga note la diferite secțiuni ale unui șir de ADN pentru a oferi informații despre acesta. De asemenea, este posibil să comparați segmente de la diferite organisme pentru a căuta variații care ar putea oferi informații importante despre specie în ansamblu.

Adnotarea manuală a genomului implică revizuirea fizică a ADN-ului. Mulți cercetători folosesc computere pentru a afișa informațiile și a le eticheta, permițându-le să le introducă în baze de date pe măsură ce lucrează. În unele cazuri, poate fi necesară o revizuire manuală după adnotarea automată, pentru a vă asigura că computerul a primit informațiile corecte. Acesta poate fi un proces minuțios și apar erori, acesta fiind unul dintre motivele pentru care cercetătorilor le place să pună în comun bazele de date. Dacă o adnotare nu se potrivește cu altele din aceeași secțiune a ADN-ului, oamenii pot evalua informațiile pentru a determina ce s-a întâmplat și pentru a remedia eroarea.

Nu este întotdeauna posibil să se determine ce face o genă în timpul procesului de adnotare a genomului. Oamenii de știință pot semnala genele și le pot separa de alte componente ale genomului, cum ar fi ADN-ul necodificator, cum ar fi repetările. Aceste informații pot fi folosite în cercetare pe măsură ce oamenii dezvoltă teorii despre diferite segmente ale genomului. Se pot adăuga la adnotări pentru a nota funcția unei gene.