Żołądek oraz jelito cienkie i grube są głównymi narządami trawiennymi, ale nie mogłyby funkcjonować bez pomocy innych narządów i gruczołów. Narządy pomocnicze układu pokarmowego to te, które w pewien sposób wspomagają trawienie, w tym poprzez produkcję i wydzielanie enzymów trawiennych. Narządy te obejmują trzustkę, wątrobę i woreczek żółciowy, a także kilka różnych gruczołów.
Bez pomocy organów pomocniczych przewodu pokarmowego, trawienie nie zachodziłoby w żołądku lub jelicie cienkim. Każdy narząd i gruczoł odgrywa bardzo specyficzną rolę w ustroju. W ten sposób są one tak samo istotne dla procesu, jak główne narządy, w których faktycznie zachodzi trawienie.
Trzustka wytwarza soki trzustkowe, które zawierają kilka różnych enzymów trawiennych. Organ ten leży bezpośrednio pod żołądkiem i wydziela soki trzustkowe bezpośrednio do dwunastnicy jelita cienkiego. Za trawienie białek odpowiedzialne są różne enzymy w sokach trzustkowych; lipidy lub tłuszcze; i węglowodany do najmniejszych jednostek, aby mogły zostać wchłonięte przez organizm. Soki trzustkowe zawierają również wodorowęglan sodu, który pomaga neutralizować kwas żołądkowy, dzięki czemu enzymy nie ulegają rozkładowi.
Wątroba jest największym organem w organizmie i pełni kilka różnych ról w utrzymaniu zdrowia i stabilnej kondycji. Jako jeden z pomocniczych narządów układu pokarmowego bierze udział w trawieniu tłuszczów znajdujących się w pożywieniu. W tym celu wytwarza zielony, wodnisty płyn zwany żółcią. Zielony kolor żółci pochodzi od pigmentu zwanego bilirubiną. Powstaje, gdy stare lub uszkodzone czerwone krwinki są rozkładane w wątrobie.
Żółć jest stale produkowana przez wątrobę i magazynowana w woreczku żółciowym. Gdy jest potrzebny do trawienia, jest opróżniany z pęcherzyka żółciowego do dwunastnicy przez przewód żółciowy. Chociaż w żółci nie ma enzymów, zawiera ona sole żółciowe niezbędne do trawienia tłuszczów i lipidów.
Sole żółciowe emulgują tłuszcze, co oznacza, że dzielą je na mniejsze kropelki, podobnie jak po dodaniu detergentu do tłuszczów i wody. Lipaza produkowana przez trzustkę jest enzymem odpowiedzialnym za trawienie lipidów do kwasów tłuszczowych. Mniejsze kropelki tłuszczów, które powstały w wyniku działania soli żółciowych, sprawiają, że trawienie przez lipazę jest dużo łatwiejsze i wydajniejsze.