Terminy „seminarium” i „szkoła biblijna” są często używane zamiennie, ale chociaż terminy są powiązane, zwykle nie są synonimami. Kolegium biblijne i seminarium są instytucjami szkolnictwa wyższego i obie skupiają się na pewnym aspekcie studiowania pism świętych; obaj mogą również nadawać stopnie naukowe z teologii lub elementów nauczania religii. Różnica leży w nadrzędnym celu instytucji. W większości przypadków kolegia biblijne są instytucjami licencjackimi, które koncentrują swoją naukę na pismach świętych i oferują stopnie naukowe o tematyce religijnej, ale zwykle oferują również stopnie naukowe w zakresie sztuki i nauk ścisłych. Z drugiej strony seminaria są na ogół instytucjami dla absolwentów, całkowicie poświęconymi przygotowaniu studentów do zostania przywódcami religijnymi.
Studenci zazwyczaj wybierają uczęszczanie do college’u biblijnego i seminarium z różnych powodów. Kolegia biblijne są zwykle rozliczane jako zwykłe uczelnie, tylko z biblijnym nastawieniem. Studenci z chrześcijańskich środowisk, którzy chcą społeczności kampusu uniwersyteckiego, która będzie pielęgnować ich przekonania, często wybierają studia biblijne. Seminarium jest przeznaczone dla studentów, którzy chcą rozpocząć karierę w posłudze.
Większość kolegiów biblijnych wymaga określonej liczby godzin zaliczenia na studiach biblijnych lub innych lekcjach religii, ale często oferują programy studiów porównywalne ze szkołami świeckimi. Studenci, którzy ukończyli szkoły biblijne, będą mieli solidne podstawy w teologii biblijnej, ale mogą podążać różnymi ścieżkami kariery. Kolegia biblijne zwykle nie kształcą studentów do żadnego konkretnego zawodu, ale raczej dążą do zapewnienia szerokiej — ale skoncentrowanej na Biblii — edukacji w college’u. Dyplom uczelni biblijnej może dotyczyć dowolnej liczby dyscyplin. Pod tym względem przede wszystkim różni się kolegium biblijne i seminarium.
Głównym celem seminarium jest kształcenie przyszłych przywódców kościelnych. Większość seminariów to instytucje na poziomie magisterskim, co oznacza, że oferują tylko stopnie magisterskie i doktoranckie. Stopień licencjata jest zwykle wymagany przed przystąpieniem do seminarium. Niektóre seminaria wymagają od kandydatów posiadania wcześniejszych stopni naukowych z religii lub teologii, jak to można uzyskać na studiach biblijnych, ale nie wszystkie.
Studenci seminarium biorą udział w kursach w ich seminarium, które są dostosowane do przygotowania ich do określonej pracy w kościele. Diakoni, księża i pastorzy zazwyczaj muszą być absolwentami seminarium, zanim będą mogli zostać wyznaczeni do przewodzenia w kościołach. Wielu pastorów świeckich posiada również dyplom seminarium duchownego.
Inną różnicą między kolegium biblijnym a seminarium jest często wyznanie. Istnieją różne rodzaje kolegiów biblijnych. Podczas gdy niektóre są ściśle związane z konkretnym kościołem, wiele innych jest międzywyznaniowych, koncentrując się na wspólnej historii biblijnej, poza konkretną tradycją kościelną. Seminaria prawie zawsze są jednowyznaniowe. Wielokrotny wybór kolegium biblijnego lub seminarium zależy od przynależności do kościoła studenta.
Każde wyznanie chrześcijańskie ma inne wymagania wobec swoich przywódców. W niektórych kościołach, takich jak Kościół rzymskokatolicki, kapłaństwo jest zarezerwowane dla mężczyzn. Seminaria katolickie są zatem otwarte tylko dla mężczyzn, a oferowane lekcje, kursy i stopnie naukowe mają specyficznie katolicki charakter. Seminaria postępują zgodnie z naukami wyznania założycielskiego i zwykle przygotowują studentów do posługi w określonym kościele.
Czasami szkoła oferuje zarówno szkołę biblijną, jak i seminarium. Obaj często dzielą się wydziałami, ale studenci są zazwyczaj ograniczeni do jednego programu. Dyplom uczelni biblijnej może prowadzić do przyjęcia do seminarium, a goszczenie tych samych szkół w jednym kampusie ułatwia przejście. Jednak zazwyczaj nie ma żadnej bezpośredniej korelacji między uczęszczaniem do college’u biblijnego a seminarium.