Solarny podgrzewacz szklarniowy ma kilka zalet, a także kilka wad. Niezbędne ciepło zapewnia słońce, które jest czystym, odnawialnym zasobem. Osoba z słonecznym grzejnikiem szklarniowym będzie miała zazwyczaj znacznie niższe rachunki za energię niż osoba, której szklarnia jest ogrzewana innymi rodzajami grzejników szklarniowych. Z drugiej strony w pochmurne dni może być zbyt mało ciepła. Ponadto niektóre urządzenia do szklarni słonecznej mogą być drogie i może być trudno utrzymać stałą temperaturę wewnątrz szklarni słonecznej przy użyciu tego typu grzejnika.
Jedną z największych zalet słonecznego grzejnika szklarniowego jest to, że słońce jest zasobem całkowicie odnawialnym. Niektóre grzejniki szklarniowe są zasilane gazem ziemnym, który jest zasobem nieodnawialnym. Solarny grzejnik szklarniowy jest również znacznie lepszy dla środowiska, ponieważ energia zużywana przez te grzejniki jest czysta. Używanie promieni słonecznych do ogrzewania szklarni nie powoduje żadnych niebezpiecznych produktów ubocznych ani chemikaliów. Z drugiej strony niektóre paliwa kopalne często powodują powstawanie niebezpiecznych produktów ubocznych, takich jak substancje rakotwórcze.
Szklarnie ogrzewane gazem ziemnym lub elektrycznie mogą być drogie w utrzymaniu. Z drugiej strony, używając słonecznego grzejnika szklarniowego, osoba zwykle nie musi się martwić o wysokie rachunki za gaz lub prąd. Słońce jest darmowym zasobem i nikt nie jest obciążony za jego używanie.
Jednak może być potrzebny grzejnik gazowy lub elektryczny jako uzupełnienie słonecznego grzejnika szklarniowego jako zapasowego. Jedną z największych wad energii słonecznej jest to, że nie zawsze jest ona całkowicie niezawodna. Na przykład w pochmurne dni w chłodniejszych miesiącach słońce może nie zapewniać wystarczającej ilości ciepła, aby rośliny były zdrowe.
Budowa słonecznego grzejnika szklarniowego może również kosztować nieco więcej niż zakup tradycyjnego systemu lamp grzewczych. Dostawy do szklarni słonecznych mogą być dość drogie. Jeśli dana osoba planuje używać paneli słonecznych, wpłynie to również na koszt budowy szklarni słonecznej, ponieważ są one zwykle drogie.
Regulacja temperatury wewnątrz szklarni za pomocą grzejnika słonecznego może być czasami trudna. Podczas gorących miesięcy wnętrza tych szklarni mogą być zbyt ciepłe. Zazwyczaj można temu zaradzić, otwierając drzwi lub okno.