Rodzaj leczenia stosowanego w przypadku torbieli brzusznej zazwyczaj zależy od rodzaju torbieli. Torbiele brzuszne płodu zwykle nie wymagają żadnego leczenia i same ustępują. W przypadku torbieli jajników leczenie może obejmować zarówno częste monitorowanie, jak i leczenie hormonalne, a także operację. Zarówno torbiele krezki, które występują w otrzewnej na tylnej ścianie brzucha, jak i torbiele sieci, które rozwijają się na przedniej ścianie brzucha, zazwyczaj wymagają operacji usunięcia. W przypadku torbieli krezki często konieczna jest również dodatkowa operacja resekcji jelita lub jelit.
Torbiele brzuszne płodu są jednymi z najczęstszych typów, szczególnie u niemowląt płci żeńskiej, które były narażone na wysoki poziom hormonów w macicy. Po urodzeniu dziecka te łagodne torbiele zazwyczaj rozpuszczają się same i nie wymagają dalszego leczenia. W rzadkich przypadkach torbiel będzie wystarczająco duża, aby stanowić zagrożenie dla niemowlęcia, lub może po prostu nie ustąpić sama, a wtedy konieczna może być operacja w celu jej usunięcia.
Torbiele jajników są również dość powszechne, a ich leczenie często zależy od ich ciężkości. Pierwszym sposobem działania będzie zwykle obserwowanie ich w celu monitorowania wzrostu i umożliwienia im samodzielnego rozwiązania. To może nie wystąpić, ale dopóki torbiele nie powodują problemów, leczenie może nie być konieczne.
Jeśli torbiele jajników rosną, można podać doustne środki antykoncepcyjne, aby zatrzymać ich wzrost i zmniejszyć je. Leki przeciwbólowe mogą być również konieczne w celu złagodzenia powodowanego przez nie dyskomfortu. W przypadku większych torbieli, które powodują silny ból lub krwawienie i nie reagują na tabletki antykoncepcyjne, może być konieczna operacja. W zależności od sytuacji można to zrobić laparoskopowo lub przez większe nacięcie w ścianie jamy brzusznej.
Torbiel krezkowa lub sieciowa brzucha może przebiegać bezobjawowo, ale te, które wymagają leczenia, zwykle wymagają chirurgicznego usunięcia. Torbiele krezki powstają w części otrzewnej zwanej krezką, która często umieszcza je w bliskim sąsiedztwie jelit i jelit. W wielu przypadkach oznacza to, że po usunięciu torbieli konieczne będzie również wycięcie jelita lub jelit. Torbiele omentalne, które zwykle znajdują się w przedniej ścianie brzucha, zwykle można usunąć bez dodatkowego wpływu na pobliskie narządy.