Różne rodzaje leczenia wodonercza na ogół zależą od lokalizacji niedrożności, ponieważ początkowym celem jest odsączenie uwięzionego moczu. Po usunięciu moczu skupienie się na leczeniu zmienia się na zapewnienie, że problem się nie powtórzy. Leczenie wodonercza zwykle rozpoczyna się od wprowadzenia cewnika lub rurki do ciała w celu odprowadzenia płynu. Gdy to zostanie zakończone, blokada często musi zostać usunięta, zwykle za pomocą operacji.
Usunięcie uwięzionego moczu i złagodzenie nacisku na nerki jest głównym celem leczenia wodonercza, ponieważ jest to ważne w zapobieganiu uszkodzeniom nerek. Często osiąga się to przez cewnik, który jest wprowadzany do pęcherza. Leczenie nagromadzenia moczu czasami obejmuje jednak wprowadzenie miękkich rurek bezpośrednio do nerki. W większości przypadków zablokowanie górnych dróg moczowych wymaga cewnika, podczas gdy zablokowanie w dolnym odcinku wymaga cewnika.
Odprowadzanie moczu z wnętrza nerki jest istotną częścią leczenia wodonercza, ale nie rozwiązuje podstawowego problemu. Blokada zwykle musi zostać usunięta, w przeciwnym razie z czasem mocz będzie się ponownie narastał. Nie wszystkie przypadki wymagają operacji, ale większość wymaga.
Podobnie jak w przypadku procesu drenażu, rodzaj operacji wodonercza zależy od lokalizacji niedrożności. Jednak konieczne jest leczenie wodonercza w celu wyeliminowania blokady; jeśli jest pozostawiony przez długi czas, stan może spowodować trwałe uszkodzenie nerek. W przeszłości stosowano techniki chirurgii otwartej lub laparoskopowej, ale chirurgia endoskopowa jest obecnie bardziej powszechna w przypadku tego schorzenia i zwykle jest mniej inwazyjna.
Jeśli zablokowanie jest spowodowane zwężeniem moczowodu, który jest rurką odprowadzającą mocz do pęcherza, może być wymagana operacja usunięcia tego odcinka. Jeśli stan jest spowodowany kamieniem w nerce, często wymagane jest również usunięcie. Wiele osób całkowicie wyzdrowieje po operacji wodonercza, o ile choroba zostanie złapana stosunkowo wcześnie.
Właściwe leczenie zależy również od ciężkości stanu i tego, czy jest on przewlekły, czy ostry. Jeśli stan jest przewlekły, co oznacza, że narasta powoli, leczenie zwykle nie jest pilne, ale musi nastąpić na pewnym etapie. Jeśli objawy są bardziej ostre, konieczne może być szybsze wykonanie drenażu moczu, aby zapobiec długotrwałemu uszkodzeniu nerek.