Το έκτο τσάκρα, γνωστό στα σανσκριτικά ως ajna, αναφέρεται συχνά ως τσάκρα του τρίτου ματιού και λέγεται ότι βρίσκεται στο μέτωπο, ακριβώς πάνω από τη μύτη. Σύμφωνα με άτομα που ασκούν την κουνταλίνι και άλλες μορφές γιόγκα, αυτό το τσάκρα είναι το κέντρο του σώματος για πνευματικές ενέργειες που σχετίζονται με την ακριβή αντίληψη, την κατανόηση και την πνευματική οξύτητα. Οι ενέργειες του έκτου τσάκρα λέγεται ότι επηρεάζουν τα μάτια, τον εγκέφαλο, την επίφυση και την υπόφυση. Ανισορροπίες ή μπλοκαρίσματα σε αυτό το τσάκρα πιστεύεται ότι οδηγούν σε ημικρανίες, απώλεια όρασης, δυσάρεστα όνειρα και καταπόνηση των ματιών. Οι ασκούμενοι των τεχνών της γιόγκα πιστεύουν ότι η θετική σκέψη, το άσμα μάντρας και η εκτέλεση αντεστραμμένων και προσανατολισμένων στην ισορροπία στάσεων γιόγκα μπορούν να καθαρίσουν τα μπλοκαρίσματα από το έκτο τσάκρα και να εξισορροπήσουν τις ενέργειές του.
Οι ενέργειες του έκτου τσάκρα λέγεται ότι έχουν ισχυρή επιρροή στο μυαλό και κατ’ επέκταση στο ενδοκρινικό σύστημα. Οι ασκούμενοι της γιόγκα πιστεύουν συχνά ότι το μυαλό και το σώμα είναι εγγενώς αλληλένδετα, έτσι ώστε η ψυχική κατάσταση μπορεί να έχει τη δύναμη να επηρεάσει τη φυσική κατάσταση. Σύμφωνα με αυτές τις πεποιθήσεις, κάποιος που καλλιεργεί θετικές σκέψεις και ένα ήρεμο, ελεγχόμενο μυαλό μπορεί να είναι πιο πιθανό να απολαμβάνει καλή σωματική υγεία.
Το τσάκρα του τρίτου ματιού πιστεύεται ότι είναι υπεύθυνο για την ικανότητα αντίληψης και κατανόησης της πραγματικότητας. Οι διαταραχές στο τσάκρα του τρίτου ματιού πιστεύεται ότι προκαλούν διαταραχές στην αντίληψη και αποσύνδεση από την πραγματικότητα. Οι αρνητικές σκέψεις και τα συναισθήματα, όπως ο φόβος, πιστεύεται ότι προκύπτουν από διαταραχές στην ενεργειακή ισορροπία του έκτου τσάκρα.
Πολλοί ασκούμενοι της γιόγκα πιστεύουν ότι η κατάλληλη στάση είναι ζωτικής σημασίας για να καθαρίσει το έκτο τσάκρα και να εξισορροπήσει τις ενέργειές του. Μια ακατάλληλη στάση, στην οποία το κεφάλι αφήνεται να προεξέχει προς τα εμπρός, πιστεύεται ότι συμβάλλει στην απόφραξη του τσάκρα του τρίτου ματιού. Η καλλιέργεια θετικών σκέψεων και πεποιθήσεων λέγεται επίσης ότι είναι πολύ ευεργετική για την καλή λειτουργία του τσάκρα του τρίτου ματιού. Οι επιβεβαιώσεις και τα μάντρα που χρησιμοποιούν τον ριζικό ήχο “om” λέγεται ότι είναι ευεργετικά για την εστίαση των ενεργειών του τσάκρα του τρίτου ματιού.
Οι άνθρωποι που κάνουν hatha yoga πιστεύουν συνήθως ότι οι στάσεις της γιόγκα που προσανατολίζονται στην ισορροπία μπορούν να ωφελήσουν το τσάκρα του τρίτου ματιού. Πόζες όπως η πόζα του χορευτή πιστεύεται ότι βοηθούν στην ηρεμία και στην εστίαση του μυαλού. Οι ανεστραμμένες στάσεις, όπως η στάση στους ώμους, πιστεύεται επίσης ότι ηρεμούν το μυαλό και ωφελούν το τσάκρα του τρίτου ματιού.