Η αλιζαρίνη είναι μια χημική ένωση που βρίσκεται φυσικά στις ρίζες ορισμένων ειδών της οικογένειας madder και παράγεται συνθετικά από μια βάση ανθρακινόνης. Σε καθαρή μορφή, η αλιζαρίνη είναι κοκκινωπό-πορτοκαλί και μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως χρωστική ουσία ή βαφή για μια μεγάλη ποικιλία έργων. Είναι διάσημο για το ότι είναι πολύ γρήγορο και οπτικά τολμηρό και έχει χρησιμοποιηθεί από πολλούς ανθρώπινους πολιτισμούς στις τέχνες και στη χειροτεχνία, καθώς και στην παραγωγή υφασμάτων για στολές και άλλα ρούχα. Η ένωση αναφέρεται στο όνομα του βυσσινί αλαζαρίνης, ένα χρώμα που φτιάχτηκε ιστορικά με αυτήν την ένωση.
Ένα είδος madder, Rubia tinctorum ή dye madder, έχει υψηλές συγκεντρώσεις αυτής της ένωσης στις ρίζες του. Ορισμένες πρώιμες ανθρώπινες κοινωνίες σε περιοχές όπως η Αίγυπτος και η Ινδία χρησιμοποιούσαν το madder στην παραγωγή βαφών για ρούχα, καθώς και χρωστικές για βαφή. Το Alizarin ήταν το περίφημο κόκκινο που χρησιμοποιήθηκε στην παραγωγή στρατιωτικών στολών για την Αγγλία τον 18ο αιώνα, και χρησιμοποιήθηκε επίσης στην παραγωγή στολών του γαλλικού στρατού.
Στη δεκαετία του 1800, οι χημικοί ανακάλυψαν πώς να σταθεροποιήσουν το madder και να το κάνουν πιο μακροχρόνια, πιο ανθεκτική στο χρώμα. Ακολούθησε στα τέλη της δεκαετίας του 1860 η ανάπτυξη μιας συνθετικής εκδοχής της αλιζαρίνης. Η σύνθεση της χημικής ένωσης επέτρεψε στους ανθρώπους να παράγουν κόκκινες και πορτοκαλί βαφές για ένα κλάσμα του προηγούμενου κόστους τους και οδήγησε σε απότομη πτώση της αξίας του madder, καθώς ήταν δυνατή η παραγωγή χρωστικών και χρωστικών πολύ πιο φθηνά και γρήγορα με συνθετική αλιζαρίνη. Αυτή η ένωση ήταν η πρώτη φυσική φυτική βαφή που συντέθηκε και την ακολούθησαν πολλές άλλες.
Μια χρήση της αλιζαρίνης που επιμένει μέχρι σήμερα είναι η παρασκευή λεκέδων για τη χημεία και τη βιολογία. Η κόκκινη βαφή υπογραμμίζει τις δομές που μας ενδιαφέρουν και μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε δοκιμές όπου οι λεκέδες είναι απαραίτητοι για τον εντοπισμό συγκεκριμένων οργανισμών ή άλλων ανησυχητικών πραγμάτων σε ένα δείγμα. Οι συνθετικές βαφές χρησιμοποιούνται συνήθως για λεκέδες σήμερα, καθώς είναι πιο σταθερές, αξιόπιστες και προσιτές για εργαστηριακή χρήση.
Είναι ακόμα δυνατό να βρούμε βαφές με βάση την αλιζαρίνη που παρασκευάζονται με madder και όχι συνθετικά. Ορισμένοι τεχνίτες ενδιαφέρονται να δουλέψουν με φυσικές φυτικές βαφές και μπορούν να συλλέγουν, να επεξεργάζονται και να σταθεροποιούν τις δικές τους βαφές για να τις κάνουν πιο ανθεκτικές και πιο ανθεκτικές στο χρώμα. Τα καταστήματα χειροτεχνίας πωλούν περιστασιακά φυτικές βαφές συσκευασμένες στο εμπόριο για χρήση από άτομα που ενδιαφέρονται να πεθάνουν, αλλά δεν έχουν τις δεξιότητες και τις εγκαταστάσεις για να προετοιμάσουν τις βαφές τους στο σπίτι ή στο εργαστήριο.