Το ενδόδερμα, ή ενδόδερμα, είναι ένα από τα τρία εμβρυϊκά βλαστικά στρώματα που μαζί δημιουργούν όλους τους ώριμους ιστούς και όργανα του σώματος. Από μέσα προς τα έξω, οι τρεις κυτταρικές στοιβάδες είναι το ενδόδερμα, το μεσόδερμα και το εξώδερμα. Τα κυτταρικά στρώματα προκύπτουν νωρίς στην εμβρυϊκή ανάπτυξη, όταν μια κοιλότητα που ονομάζεται archenteron σχηματίζεται στο κέντρο του blastula, μια μικροσκοπική μπάλα αδιαφοροποίητων κυττάρων και τα κύτταρα αρχίζουν να αναδιοργανώνονται σε βλαστικά στρώματα. Το ενδοδέρμιο είναι το πρώτο που σχηματίζεται και αρχίζει να σχηματίζεται στο ανθρώπινο έμβρυο περίπου δύο εβδομάδες μετά τη γονιμοποίηση. Την πέμπτη εβδομάδα, το ενδοδερμικό έχει ήδη διαφοροποιηθεί σε όργανα.
Οι τρεις κυτταρικές στοιβάδες είναι περίπου ισοδύναμες με τη θέση των δομών στο πλήρως σχηματισμένο ανθρώπινο σώμα, με το ενδόδερμα να σχηματίζει εσωτερικές δομές, το εξώδερμα να σχηματίζει εξωτερικές δομές και το μεσόδερμα να σχηματίζει ενδιάμεσες δομές όπως ο σκελετός, ο σκελετικός μυς και η καρδιά. Μερικά ζώα δεν διαθέτουν μεσόδερμα. Το αρχεντόνιο είναι ο πρόδρομος του εντέρου ή της πεπτικής οδού και η εμφάνισή του σηματοδοτεί την έναρξη του σχηματισμού των βλαστικών στοιβάδων, μια διαδικασία που ονομάζεται γαστρίωση.
Τα κύτταρα του ενδοδερμίου είναι αρχικά επίπεδα, αλλά γίνονται στηλοειδή, με το ύψος τους να υπερβαίνει το πλάτος τους, καθώς διαφοροποιούνται. Τελικά σχηματίζουν την επένδυση του πεπτικού συστήματος στο ανθρώπινο σώμα, εκτός από μέρη του στόματος, του λαιμού και του ορθού. Το ενδοδέρμιο δημιουργεί επίσης μεγάλο μέρος του εσωτερικού επιθηλιακού ιστού που καλύπτει τα όργανα και τους αδένες.
Το ενδόδερμα σχηματίζει επίσης τους αεραγωγούς στους πνεύμονες: την τραχεία, τους βρόγχους και τις κυψελίδες. Γυαλίζει όλους τους αδένες που ανοίγουν στον πεπτικό σωλήνα, συμπεριλαμβανομένου του παγκρέατος και του ήπατος, καθώς και τα ωοθυλάκια του θύμου αδένα, που παράγει Τ-λεμφοκύτταρα ή Τ-κύτταρα, και του θυρεοειδούς αδένα, που παράγει μια σειρά από σημαντικές ρυθμιστικές ορμόνες. Δημιουργεί επίσης το επιθήλιο της ευσταχιανής σάλπιγγας και την τυμπανική κοιλότητα στο αυτί και την ουροδόχο κύστη και την ουρήθρα.