Το πόσο καιρό οι φάλαινες ζουν σε γλυκό νερό έχει γίνει θέμα συζήτησης με αρκετές επισκέψεις φαλαινών σε περιβάλλοντα γλυκού νερού. Το ενδιαφέρον για αυτό το θέμα κορυφώθηκε για πρώτη φορά όταν ο Humphrey, η φάλαινα, έκανε μια παράκαμψη στον ποταμό Σακραμέντο το 1985 κατά τη διάρκεια της ετήσιας περιόδου μετανάστευσης φαλαινών. Ο Χάμφρεϊ κατάφερε αρκετές εβδομάδες στο υφάλμυρο νερό (γλυκό νερό) του ποταμού Σακραμέντο πριν επιστρέψει τελικά στον κόλπο του Σαν Φρανσίσκο και στη συνέχεια στον Ειρηνικό Ωκεανό. Το θέμα επανεξετάστηκε τον Μάιο του 2007, όταν μια μητέρα καμπούρα και το μοσχάρι της μπήκαν στον ποταμό Σακραμέντο.
Γενικά, ορισμένοι ειδικοί λένε ότι είναι ασυνήθιστο να βλέπουμε φάλαινες σε γλυκό νερό για περισσότερες από μερικές εβδομάδες. Υπάρχουν μερικά είδη δελφινιών που είναι ειδικά θηλαστικά γλυκού νερού, αλλά οι περισσότερες φάλαινες είναι φτιαγμένες για περιβάλλον αλμυρού νερού. Οι επιστήμονες δεν είναι ακριβώς σίγουροι για το πόσο καιρό οι φάλαινες μπορούν να ζήσουν στο γλυκό νερό αφού είναι θηλαστικά με αλμυρό νερό. Ένα ζήτημα είναι ότι στο γλυκό νερό, δεν έχουν πρόσβαση στις κανονικές πηγές τροφής τους.
Μια πρόσθετη ανησυχία για τις φάλαινες στο γλυκό νερό είναι ότι το αλμυρό νερό εκτελεί κάποιες φυσικές λειτουργίες για τη φάλαινα. Μικρές κοπές ή γρατζουνιές, για παράδειγμα, θεραπεύονται εύκολα σε αλμυρό νερό. Τα περιβάλλοντα γλυκού νερού δεν παρέχουν πρόσβαση στις ευεργετικές θεραπευτικές πτυχές του αλατιού. Σημειώθηκε στο περιστατικό του Σακραμέντο το Μάιο του 2007 ότι και οι δύο φάλαινες φαίνεται να τραυματίστηκαν από την προπέλα ενός σκάφους. Ευτυχώς, οι δύο φάλαινες σε αυτή την περίπτωση μεταφέρθηκαν στον Ειρηνικό Ωκεανό περίπου δύο εβδομάδες μετά την εμφάνισή τους στο Δέλτα του Σακραμέντο.
Τα περιβάλλοντα γλυκού νερού δεν είναι επίσης φυσικά για κολύμβηση και καταδύσεις φαλαινών. Οι περισσότερες φάλαινες κολυμπούν σε νερό που έχει βάθος τουλάχιστον 20 πόδια (6.1 μέτρα), αν όχι αρκετά βαθύτερο. Τα ποτάμια γλυκού νερού μπορεί να είναι μόνο λίγα πόδια βαθύτερα από την περίμετρο του σώματος μιας φάλαινας. Αυτό καθιστά πιο πιθανό να βρεθούν σε παραλία.
Η φάλαινα της φάλαινας και πολλά άλλα είδη φαλαινών είναι μεταναστευτικά ζώα από συνήθεια. Οι αποκλίσεις από τυπικά μοτίβα μετανάστευσης μπορούν να δημιουργήσουν προβλήματα στις φάλαινες. Δεδομένου ότι δεν είναι συνηθισμένοι στη διαδρομή που ακολουθούν, οι φάλαινες μπορούν εύκολα να μπερδευτούν. Το ένστικτο της μετανάστευσης είναι έμφυτο, οπότε όσο ενδιαφέρον και αν είναι να βλέπουμε φάλαινες σε γλυκό νερό, είναι θέμα ανησυχίας για τους λάτρεις των φαλαινών.
Όταν είναι δυνατόν, οι κυβερνήσεις και οι περιβαλλοντικές ομάδες χρησιμοποιούν τους πόρους τους για να βοηθήσουν τις φάλαινες να επιστρέψουν στο φυσικό τους περιβάλλον το συντομότερο δυνατό. Οι θαλάσσιοι βιολόγοι είναι βέβαιοι ότι η βιολογία της φάλαινας δεν μπορεί να επιβιώσει επ ‘αόριστον σε υφάλμυρο νερό και ότι το πολύ, λίγες φάλαινες σε γλυκό νερό θα επιβιώσουν περισσότερο από ένα μήνα.