Podczas ekstrakcji chlorofilu naukowiec musi osłabić ściany komórkowe zielonego liścia lub rośliny, a następnie wyciągnąć chlorofil. Chlorofil znajduje się w każdej komórce zielonych liści, umożliwiając roślinom przeprowadzanie fotosyntezy. W postaci cieczy chlorofil wyleje się z liści po poddaniu działaniu ciepła i umieszczeniu w niektórych chemikaliach. Ten proces na ogół niszczy liście, więc należy użyć tylko kilku liści z każdej żywej rośliny, aby zachować cały okaz.
Bardzo zielone liście zazwyczaj lepiej reagują na ekstrakcję chlorofilu niż liście jasnozielone. Szpinak, jarmuż, escarole i wszelkie ciemnozielone liście z drzew ogólnie dobrze działają. Jasne sałaty i puszyste ucho jagnięce zwykle nie działają tak dobrze. Liście również powinny być miękkie. Twarde, zimozielone liście, takie jak liście ostrokrzewu lub igły sosny, zwykle nie rozkładają się na tyle, aby uwolnić chlorofil. Evergreeny rozwinęły wiele mechanizmów trzymania swoich zasobów i generalnie nie rezygnują z nich łatwo.
Podczas ekstrakcji chlorofilu liście należy podgrzać i zwiędnąć. Można to zrobić na dwa sposoby. Naukowiec może parować liście, umieszczając je na sicie nad wrzącą wodą lub po prostu zanurzając je w wodzie. Gotowanie na parze więdnie i rozkłada liście, nie zamieniając ich w papkę. Niektórzy twierdzą, że pozwala to obserwatorom wyraźniej zobaczyć wydobycie. Ci, którzy używają którejkolwiek metody gotowania, powinni usunąć liście z ognia, gdy są bardzo zwiędłe, miękkie i giętkie.
Następnym krokiem w ekstrakcji chlorofilu jest zawieszenie liści w jakimś szklanym pojemniku. Puste słoiki z jedzeniem dla niemowląt działają dobrze, podobnie jak szklane szklanki do picia. Pojemnika użytego w tym eksperymencie zasadniczo nie należy używać do jedzenia po zakończeniu ekstrakcji.
Naukowiec następnie zwykle wiąże razem łodygi zwiędłych liści i delikatnie zawiązuje je bawełnianym sznurkiem. Przywiązany do środka ołówka sznurek powinien pozwalać liściom zwisać w szklanym pojemniku, nie dotykając dna ani boków. Chociaż ten krok nie jest konieczny, pozwala naukowcowi usunąć liście z pojemnika, aby pokazać wszelkie zmiany koloru, które zachodzą po usunięciu chlorofilu.
Alkohol do nacierania jest typowym płynem wybieranym podczas ekstrakcji chlorofilu. Wyciąga chlorofil z liści do cieczy. Naukowiec powinien po prostu napełnić pojemnik po brzegi spirytusem i pozostawić zestaw na około 20 minut. Płyn powinien zmienić kolor na zielony. Kiedy naukowiec wyciąga liście z płynu, powinny być brązowe, ponieważ nie ma w nich już chlorofilu.