Procedury związane z wytwarzaniem antybiotyków zależą od tego, czy produkt jest naturalny, półsyntetyczny czy w pełni syntetyczny. Naturalne leki powstają poprzez hodowlę mikroorganizmów w kontrolowanych warunkach i zbieranie związków, które wyrażają, podczas gdy produkty półsyntetyczne obejmują dodatkowy etap modyfikacji naturalnie wytwarzanych chemikaliów. Syntetyki, podobnie jak sulfonamidy, są wytwarzane w procesie chemicznym. Produkcja antybiotyków we wszystkich przypadkach wymaga sterylnego środowiska z ciągłym monitorowaniem w celu sprawdzenia oznak zanieczyszczenia, które mogą zakłócać bezpieczną produkcję leków.
Naturalne antybiotyki wymagają przygotowania kultury mikroorganizmów, takich jak grzyby, które wyrażają antybiotyki jako produkt uboczny. Są hodowane w dużych zbiornikach fermentacyjnych z pożywieniem, aby mogły się rozmnażać. Mikrobiolog nadzoruje proces, kontrolując temperaturę, wilgotność i inne warunki w celu zwiększenia wydajności. Przygotowanie bulionu z antybiotykiem, który musi zostać przepuszczony przez systemy filtracji w celu oczyszczenia i wyekstrahowania leku, może zająć kilka dni. Testy upewniają personel, że produkcja antybiotyków nie była skażona, a lek jest wystarczająco silny, aby mógł być sprzedawany publicznie.
Leki półsyntetyczne dodają do tego krok. Zamiast oczyszczania i pakowania naturalnego produktu, pracownicy zakładu produkcyjnego poddają go procesowi chemicznemu. Ten etap produkcji antybiotyków modyfikuje strukturę leku. Nie jest w pełni syntetyczny, bo bazuje na produkcie naturalnym, ale nie jest to ten sam produkt, który można znaleźć w naturze. Leki te mogą być bardziej zjadliwe przeciwko szerszemu zakresowi organizmów lub mogą mieć mniej skutków ubocznych niż ich naturalne formy. Ampicylina jest przykładem półsyntetycznego antybiotyku.
Leki syntetyczne powstają w wyniku reakcji chemicznych, zaczynając od surowca modyfikowanego w kontrolowanym środowisku. Produkcja antybiotyków w procesach syntetycznych może być łatwiejsza do kontrolowania, ponieważ nie podlega naturalnym zmianom organizmów żywych stosowanych w zbiornikach fermentacyjnych. Nadal wymaga starannego monitorowania w celu sprawdzenia zanieczyszczenia i wytworzenia leków, które są czyste io standardowym stężeniu.
Podobnie jak w przypadku innych farmaceutyków, produkcja antybiotyków podlega regulacjom rządowym. Agencje mogą kontrolować zakłady produkcyjne i partie produktów z prawem do wycofania leków, jeśli istnieją obawy dotyczące bezpieczeństwa lub skuteczności. Mogą również zażądać dzienników dokumentujących procedury testowania i kontroli jakości, aby potwierdzić, że firma posiada jasne standardy wewnętrzne i zawsze ich przestrzega.