Pod hipnozą ludzie rutynowo zgłaszają uczucie spokoju i relaksu, a także zmniejszone poczucie bólu. Dzięki zastosowaniu obrazowania mózgu naukowcy zauważyli, że kora przedczołowa mózgu, która zarządza czynnościami, takimi jak skupienie uwagi i podejmowanie decyzji, wykazuje wyraźną zmianę w swoich zwykłych wzorcach, gdy osoba poddawana jest hipnozie. Zmiany te potwierdzają, że faktycznie odczuwa się mniej bólu, a nie jest on jedynie wyobrażony, oraz że świadomość faktycznie wzrasta, gdy świadomość osoby zostaje zmieniona przez hipnozę.
Kiedy umysł jest pod hipnozą, często zakłada się, że ludzie śpią i nie mają kontroli nad swoim zachowaniem. W rzeczywistości jest odwrotnie. Pod hipnozą część poznawcza mózgu, która zazwyczaj zajmuje się logiką i myśleniem, jest bardziej aktywna niż w stanie niehipnotycznym. To właśnie wtedy, gdy dana osoba jest pod hipnozą, myśląca część mózgu jest w rzeczywistości silniejsza, a tym samym może lepiej oprzeć się uzależniającym zachowaniom lub znieść ból, nie dając się przez nie przytłoczyć.
Hipnoterapia jest często stosowana w leczeniu stanów lękowych i chorób związanych ze stresem, takich jak choroba Leśniowskiego-Crohna i zespół jelita drażliwego. Badania potwierdzają, że hipnoterapia skutecznie zmniejsza objawy takich chorób, ponieważ psychiczne skutki hipnozy prowadzą do głębszego relaksu. Po poddaniu się hipnozie ludzie odczuwają również fizyczną ulgę w objawach często spowodowanych stresem, takich jak problemy żołądkowo-jelitowe, bóle głowy, bezsenność i zmęczenie.
Podczas hipnozy osoba jest wyraźnie spokojniejsza, ale dzięki sile sugestii hipnotycznej efekty hipnozy mogą również pomóc osobie po zakończonej sesji hipnoterapii. Na przykład podczas hipnozy można zasugerować osobie, aby oddychała głęboko w obliczu stresu w przyszłości lub była bardziej świadoma tego, jak czuje się ciało w obliczu lęku. Tworząc podwyższoną świadomość pohipnotyczną, osoba może pracować nad przeciwdziałaniem negatywnym reakcjom, celowo rozluźniając mięśnie ciała i biorąc kilka oczyszczających oddechów, zamiast popadać w niekontrolowaną reakcję emocjonalną w obliczu przyszłych stresujących sytuacji.
Korzyści są nie tylko doświadczane, gdy hipnoterapeuta poddaje się hipnozie, ale badania pokazują, że te same reakcje można osiągnąć również przez autohipnozę. Emocjonalne skutki hipnozy okazały się nawet bardzo korzystne dla kobiet poddawanych biopsji piersi, a także w radzeniu sobie z bólem po takim zabiegu. Lęk często towarzyszy procesowi biopsji piersi, która polega na odcięciu części tkanki piersi do badania. Niepokój jest również odczuwalny ze względu na możliwość zdiagnozowania raka. Badania wykazały jednak, że kobiety, które są doprowadzane do autohipnozy, rzadziej doświadczają wysokiego poziomu lęku związanego z tą procedurą.