Apteka ambulatoryjna to apteka, która realizuje recepty dla pacjentów powiązanych z nadrzędną placówką medyczną apteki, zazwyczaj szpitalem lub przychodnią. Zazwyczaj placówki te realizują tylko recepty związane z leczeniem w placówce macierzystej lub jednej z jej przychodni, w przeciwieństwie do bardziej konwencjonalnej apteki, która realizuje recepty dla każdego. Szpitale zazwyczaj oferują usługi aptek ambulatoryjnych jako udogodnienie dla swoich pacjentów, a czasem także dla personelu.
Zasady dotyczące tego, kto może realizować recepty w aptece ambulatoryjnej, różnią się w zależności od polityki apteki. Zwykle osoby przebywające w szpitalu mogą tam realizować swoje recepty, podobnie jak osoby, które właśnie zostały wypisane z receptami, które należy zrealizować. Ponadto apteka obsługuje recepty od osób będących w terapii ambulatoryjnej, a wiele z nich realizuje również recepty dla personelu szpitala.
Podobnie jak w przypadku innych rodzajów aptek, apteka ambulatoryjna może zwykle obsługiwać zarówno recepty pisemne, jak i wysyłane przez telefon. Ze względu na konieczność łączenia złożonych leków w placówce szpitalnej, apteki te mogą również oferować specjalistyczne leki i preparaty swoim pacjentom, zamiast zamawiać je na specjalne zamówienie.
Pacjenci korzystający z apteki ambulatoryjnej w przeciwieństwie do zwykłej apteki mają kilka zalet. Po pierwsze, apteka znajduje się w tym samym miejscu, w którym otrzymują leczenie, więc nie muszą robić dodatkowej podróży do apteki, aby odebrać recepty. Po drugie, personel apteki ma zwykle dużą wiedzę na temat stanu pacjenta, a personel może szybko wyłapać potencjalne konflikty narkotykowe i inne problemy, które mogą się pojawić. Apteka może również oferować zniżki na recepty.
Personel szpitala może również skorzystać z usług aptek ambulatoryjnych, odbierając potrzebne im recepty w pracy. Usługi apteczne mogą być również częścią świadczeń pracowniczych, a pracownicy otrzymują recepty po obniżonych kosztach w ramach swoich planów zdrowotnych. Pracownicy, którzy zdecydują się realizować recepty w innym miejscu, z pewnością mogą to zrobić, ale mogą być zobowiązani do poniesienia pełnych kosztów za leki.
Oprócz apteki ambulatoryjnej niektóre szpitale posiadają również aptekę stacjonarną, która w szczególności realizuje recepty dla osób hospitalizowanych. Apteka stacjonarna często znajduje się w innej części szpitala niż ambulatoryjna i może być otwarta tylko dla upoważnionego personelu, a lekarze i pielęgniarki odbierają recepty dla swoich pacjentów. Apteka ta synchronizuje również swoją dokumentację z apteką ambulatoryjną, aby zapewnić, że dane pacjenta są zawsze aktualne.