Biomining to metoda wydobywania minerałów i metali z rud macierzystych przy użyciu naturalnie występujących procesów biologicznych. Praktyka ta nie wymaga żadnych szkodliwych dla środowiska procesów występujących w konwencjonalnych metodach uszlachetniania, a zamiast tego opiera się całkowicie na naturalnej interakcji organizmów biologicznych. Proces okazał się również skuteczny w opłacalnym wydobywaniu minerałów z niskiej jakości rudy i odpadów, które wcześniej uważano za bezużyteczne. Biomining składa się z dwóch różnych technik rafinacji: bioługowania lub biooksydacji. Chociaż biologiczne uszlachetnianie minerałów jest bardzo obiecujące w przetwarzaniu szeregu pierwiastków, obecnie większość działań związanych z biowydobywaniem koncentruje się wokół wydobycia miedzi i złota.
Konwencjonalne metody wydobycia minerałów polegają na stosowaniu toksycznych chemikaliów w obecności ekstremalnie wysokich temperatur; takie procesy często pozostawiają po sobie spuściznę w postaci zniszczenia środowiska, chorób i śmierci. Czynniki te skłoniły do poszukiwania czystszych i bezpieczniejszych metod udoskonalania, bardziej zgodnych z rosnącym globalnym dążeniem do ekologicznych rozwiązań. Biogórnictwo stało się jednym z najbardziej obiecujących z nich, obejmującym wyłącznie całkowicie naturalne procesy biologiczne, ponieważ jest to skuteczność. Te metody udoskonalania wymagają niewielkiej interwencji, aby rozpocząć, nie wytwarzają toksycznych produktów ubocznych ani emisji i nie wymagają zewnętrznych źródeł paliwa. Reprezentowana przez mikrobiologiczne procesy ługowania i utleniania, biologiczne wydobycie minerałów ma wiele potencjalnych obszarów zastosowań, ale obecnie jest wykorzystywane głównie do przetwarzania złota i miedzi.
Proces bioługowania, jedna z dwóch technik uszlachetniania, jest klasycznym przykładem prostoty metod biowydobywczych. Niskogatunkowa ruda jest zrzucana na hałdę znaną jako stos ługujący i nasączana słabym roztworem kwasu siarkowego. Kwasowa reakcja z macierzą siarczkową rudy pobudza wzrost szczepu bakterii Thiobaccilus ferrooxidans, który degraduje rudę i uwalnia osady metali lub minerałów w płynnym roztworze. Ta bogata w minerały ciecz jest zbierana i oddzielana, a pozostały kwas siarkowy jest ponownie wykorzystywany w następnym cyklu ługowania.
Druga metoda biowydobycia, biooksydacja, jest szeroko stosowana do przygotowania rudy ogniotrwałej zawierającej złoto do wydobycia. Proces ten polega na wystawieniu rudy na utlenianie bakteryjne, które rozkłada nierozpuszczalne w innym przypadku składniki pirytu i arsenu. Pozwala to na przetwarzanie rudy przy użyciu znacznie mniej agresywnych metod o zmniejszonych wpływach na środowisko. Ten rodzaj korzyści sprawił, że biowydobycie rośnie szybko jako realna alternatywa dla głównego nurtu rafinacji minerałów, przy czym 25% obecnej światowej produkcji miedzi pochodzi z biowydobycia. Ten trend z pewnością będzie się utrzymywał w miarę wzrostu globalnej presji na konsumentów i dostawców, aby byli bardziej odpowiedzialni za środowisko.