Co to jest botanika algorytmiczna?

Jako dyscyplina poświęcona wykorzystaniu wirtualnych środków powiększania banku wiedzy o roślinach i ich życiu, botanika algorytmiczna udostępnia botanikowi narzędzia komputerowe do badania i symulacji szeregu różnych scenariuszy dotyczących roślin. To wykorzystanie wirtualnych narzędzi do badania wirtualnych roślin już spotkało się z dużym zainteresowaniem i jest przedmiotem głównego kierunku studiów na Uniwersytecie Calgary.

Proces botaniki algorytmicznej można najlepiej wyrazić jako modelowanie i wizualizację biologiczną, popularnie znaną jako podejście BMV. To właśnie to podejście stanowi podstawę badań prowadzonych obecnie pod auspicjami wydziału informatyki Uniwersytetu w Calgary. Zasadniczo modele botaniki algorytmicznej są opracowywane z wykorzystaniem technologii informatycznych, które są połączone z różnymi rodzajami oprogramowania w celu stworzenia wirtualnego laboratorium, w którym wirtualne rośliny są uprawiane w ściśle określonych i kontrolowanych sytuacjach. Możliwość jednoczesnego prowadzenia wielu różnych symulacji pomaga znacznie przyspieszyć proces badawczy. Botanika algorytmiczna stwarza sytuację, w której botanicy mogą swobodnie badać możliwości w bardzo krótkim czasie, a nie lata lub dekady, których wymagałyby podobne wysiłki w rzeczywistych okolicznościach.

Grupy badaczy BMV z Uniwersytetu w Calgary nie są odosobnione w swojej pracy. W projekt zaangażowane są osoby z całego świata. Praca jest zasadniczo podzielona na trzy główne elementy. Modelowanie jest elementem podstawowym i polega na stworzeniu podwalin pod wirtualne zakłady. Symulacja opiera się na bazie stworzonej przez modelowanie i pozwala naukowcom wprowadzić szereg kontrolowanych czynników do wirtualnego środowiska każdego modelu. Wizualizacja roślin pozwala na badanie produktu końcowego, który jest wytwarzany przez szereg wprowadzonych czynników, dostarczając cennych informacji na temat wykonalności i celowości wykorzystania tych czynników w rzeczywistych zastosowaniach.

W listopadzie 2007 roku na Piątych Dorocznych Warsztatach Funkcjonalno-Strukturalnego Modelowania Roślin zebrali się ludzie zainteresowani postępami botaniki algorytmicznej. Warsztaty, które odbyły się w Napier w Nowej Zelandii, były otwarte dla osób związanych z projektem University of Calgary, a także niezależnych badaczy wykorzystujących w swoich pracach jakąś formę botaniki algorytmicznej.