Wprowadzenie popcornu do mikrofali w latach 1980. wydawało się naturalnym postępem po sukcesie popcornu z płyty kuchennej i popcornu z powietrzem. Konsument wkłada złożoną torbę zawierającą olej, aromat i popcorn do kuchenki mikrofalowej na kilka minut. Wyniki mogą być różne, od do połowy wyciśniętej torby po worek do palenia z węglem, ale ogólnie popcorn do mikrofali był podobny do innych form popcornu i robiony w znacznie krótszym czasie.
Pytania dotyczące bezpieczeństwa popcornu do mikrofali zaczęły się pojawiać, gdy wielu pracowników fabryki popcornu zaczęło zgłaszać poważne problemy z oddychaniem podczas pracy z chemikaliami używanymi do przetwarzania popcornu. Podejrzewanym czynnikiem drażniącym był związek chemiczny znany jako diacetyl. Diacetyl jest używany do tworzenia maślanego smaku w różnych przyprawach i przetworzonej żywności, w tym w sztucznym maślanym smaku używanym do popcornu do mikrofali. Małe ilości diacetylu nie są uważane za toksyczne, ale po podgrzaniu na skalę fabryczną opary mogą wywołać stan oddechowy znany jako płuca popcornu.
Kiedy informacja o narażeniu pracowników zajmujących się popcornem na diacetyl stała się publiczna, wielu pracowników służby zdrowia zaniepokoiło się bezpieczeństwem popcornu do mikrofali na poziomie konsumentów. FDA i inne agencje ustaliły, że ilość diacetylu zawarta w przeciętnej torbie nie osiągnęła poziomu toksycznego, chociaż krytycy kwestionowali słuszność tych ustaleń po odkryciu, że w rzeczywistości przeprowadzono niewiele testów lub nie przeprowadzono ich wcale. Praktycznie wszystkie zgłoszone przypadki popcornu w płucach wystąpiły u pracowników fabryki popcornu, ale jeden konsument, który codziennie jadł dwie paczki popcornu i zwykle wąchał opary, zachorował na łagodniejszą postać choroby.
Jeśli istnieje jakiekolwiek niebezpieczeństwo związane z popcornem do mikrofali, jest ono najbardziej widoczne, gdy torebka jest po raz pierwszy otwierana i wydostają się podgrzane opary. Wdychanie tych oparów narazi konsumenta na najwyższy możliwy poziom diacetylu na poziomie konsumenta. Może to spowodować uszkodzenie najmniejszych dróg oddechowych w płucach konsumenta lub wywołać istniejący wcześniej atak astmy. Małe dzieci i osoby z obniżoną pojemnością płuc mogą również mieć niepożądane reakcje po wdychaniu pierwszych oparów gorącej torby popcornu do mikrofali.
Inne składniki zawarte w popcornu do mikrofali nie są uważane za toksyczne, chociaż niektórzy eksperci ds. zdrowia ostrzegają przed spożywaniem dużych ilości sodu lub częściowo uwodornionych olejów. Zwykle używa zdrowszych olejów niż niektóre popcorny w stylu filmowym podawane w kinach lub na stoiskach koncesyjnych. Unikanie dodawania sztucznego masła lub dodatkowej soli to zawsze dobry pomysł na zdrowszą przekąskę.